肌球蛋白在集体协作工作模型中的力和效率.pdfVIP

肌球蛋白在集体协作工作模型中的力及效率1 1，2 1 1，3 彭艳辉 ，郭维生 ，王志坚 1 内蒙古大学理工学院物理系，呼和浩特（010021 ） 2 东北农业大学生物物理系，哈尔滨（150030 ） 3 天水师范学院数理与信息科学学院物理系，甘肃天水（741001 ） E-mail ：pygws@ 摘 要：偏布朗运动模型是描述分子马达沿轨道运动的主要理论之一，此类模型的不足之处 是不能产生足够强的力，其效率不高。本文对 Julicher 和Prost 提出的描述肌球蛋白分子集 体协作的偏布朗运动模型作了改进，定义了模型中分子马达的效率。计算表明，改进模型中 分子马达的效率可达η ≈0.75 ，同实验值相符，单个分子马达产生的力大约是原模型的 max 2 倍，比实验值小。说明将分子马达沿轨道定向运动看作粒子在一维不对称锯齿势中运动的 模型仍需进一步改进。 关键词：肌球蛋白；偏布朗运动模型；分子马达的效率 中图分类号：Q61 文献标识码：A 1. 引言 目前,描述分子马达沿轨道运动的理论模型主要有两种。其一为动力冲程模型(power stroke model)。像具有两个头部的驱动蛋白沿微管的运动,一个头部的活性域同微管上的活性 位点结合, 同时水解 ATP,产生的构象变化使得卷曲螺旋产生转动,导致另一头部移向下一个 活性位点,依此循环向前运动[1] 。其二为偏布朗运动模型(biased Brownian movement model) 。 将马达蛋白看作一维不对称势中的布朗粒子,当外部涨落存在并满足一定条件时,布朗粒子 可利用非平衡涨落的能量产生定向运动[2-3] 。Julicher 和 Prost[4]利用二态模型,将 ATP 水解时 自由能的改变看作对基态粒子的激发,研究了马达蛋白定向运动的问题。我国卓益忠等人利 用非对称势研究驱动蛋白沿微管的运动, 驱动蛋白的动力学特性得到充分的阐明[5],他们进 一步加入噪声的影响,其物理现象颇为丰富[6] 。近年,有很多实验结果支持动力冲程模型[7-8], 如调整肌球蛋白的杠杆臂长,其移动步长有相应的改变[9-10] ；也有很多实验结果支持偏布朗运 动模型[11-12],如肌球蛋白消耗一个 ATP 所移动的长度远大于杠杆臂摆动的长度[13] 。同时,也 有批评指出,偏布朗运动模型不能产生足够强的力,其效率不高[14] 。Julicher 和 Prost[15]利用偏 布朗运动模型研究了肌肉的收缩和振动。本文对 Julicher 和 Prost 提出的肌球蛋白分子集体 协作的工作模型作了改进,重新定义了模型中分子马达的效率, 旨在对偏布朗运动模型中具 有代表性的 Julicher 和 Prost 模型改进的基础上，通过对单个分子马达效率及产生力的计算 并同实验进行比较，分析是否可将分子马达沿轨道定向运动看作粒子在一维不对称锯齿势 中的运动。 2. 理论模型 为了描述肌纤维中大量肌球蛋白分子的集体工作行为,建立如图 1(A)的二态简化模型。 将每个肌球蛋白分子看作一个粒子,所有粒子以相同间距s 与一个杆(对应于肌球蛋白丝)刚 性连接.第 ) i 个粒子的位置定义为xi is +X ，X 是杆相对于轨道(对应于肌动蛋白丝) 的位 置。将肌球蛋白的工作循环简化为二个态,其一为与肌动蛋白处于结合态 σ=1,其二为与肌动 1本课题得到国家自然科学基金项目 ），内蒙古自治区教育厅高等学校科学研究项目（NJ03117 ）， 内蒙古自治区人才开发基金项目和内蒙古大学“513 人才计划”项目的资助。 -1-