青藏高原老芒麦种质遗传多样性的SSR 分析[J].pdf

中国农学通报 2010,26(9):26-33 Chinese Agricultural Science Bulletin 青藏高原老芒麦种质遗传多样性的SSR分析 1 1 2 1 1 1 鄢家俊 ，白史且 ，常 丹 ，游明鸿 ，张昌兵 ，李达旭 1 2 （四川省草原科学研究院，成都611731；四川农业大学草业科学系，四川雅安625014） 摘 要：青藏高原是世界生物多样性中心，野生老芒麦分布广泛，为了解在高寒高海拔这一特殊生态条件 下，老芒麦的遗传背景，笔者首次采用SSR 标记技术对来自青藏高原的52 份老芒麦（Elymus sibiricus L. ） 材料的遗传变异及亲缘关系进行了研究。获得下述结果：（1）18 对SSR 引物共扩增出236 条清晰的条 带，其中多态性条带204 条，多态性位点率（PPB ）为86.44% ，每对引物扩增出7~20 条带纹，平均为13.1 条，多态性信息（PIC ）含量为0.267~0.471 ，平均为0.35 ，SSR 标记效率（MI ）为3.98 ；（2 ）材料间的遗传相似 系数（GS）为0.622~0.895，平均GS 值为0.766 ，52 份种质的Nei ’s 遗传多样性指数（He ）为0.3286 ，Shannon 指数（Ho ）为0.4851 ；（3）聚类分析将52 份老芒麦材料分成5 大类，具有相同地理来源或相似生境的材料 趋向于聚为一类。以上结果表明供试材料间差异明显，具有丰富的遗传多样性，应加快对该地区野生老 芒麦资源的收集和利用。 关键词：老芒麦；青藏高原；SSR；遗传多样性；聚类分析 中图分类号：S188 文献标志码：A 论文编号：2009-2547 GeneticDiversityofWildElymussibiricusL.Germplasmfrom Qinghai-TibetanPlateauinChinaDetectedbySSRMarkers 1 1 2 1 1 1 YanJiajun,BaiShiqie,ChangDan,YouMinghong,ZhangChangbing,LiDaxu 1 (Sichuan Grassland Science Academy,Chengdu611731; 2Department of Grassland,Sichuan Agricultural University,Ya’anSichuan625014) Abstract: In order to understand the genetic background of Elymus sibiricus L. that distributed in Qinghai-TibetanPlateauwithalpineandhighaltitudeecologicalcondition,geneticdiversityof52E.sibiricus accessionswereevaluatedbySimplesequencerepeat(SSR)markers.Theresultsasfollowing:(1)Atotalof318 fragmentswereidentifiedwith 18SSRprimerssets,ofwhich204(86.48%)werepolymorphic,andeachprimer ge