原核生物基因组2010.pdf

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原核生物基因组2010

原核生物基因组 • 原核生物与真核生物 • 生物进化的二界论与三界论 – 真细菌,古细菌,真核生物 原核生物基因组的特点 • 无细胞核 • 小 • 一般只存在一条染色体 • 重复序列少 • 相关基因高度集中,往往形成操纵子 • 不存在内含子 • 一般有固定的复制起点 • …. 原核与真核生物的细胞结构 原核与真核生物基因组大小 细菌基因组结构_染色质 细菌染色体数目与形状 操纵子 • 许多功能相关的基因排列在一起,其转录受 同一启动子控制,称为操纵子。 – 大肠杆菌色氨酸操纵子trpEDCBA – 乳糖操纵子lacIZYA • 操纵子现象只占少数 – 2个基因(16.6%);4个基因(4 %),单基因 (70 %) Lac operon lacY Enzyme Function Beta galactosidase 水解糖键产生半乳糖 ( 与葡萄糖 LacZ ) Lactose Permease lacZ LacY ) 协助乳糖进入细胞内 ( Thiogalactosidase transacetylase 未知 ( LacA ) 乳糖操作子的表达机制 lac 启动子的强启动需要乳糖的诱 导和低浓度的葡萄糖 重叠基因(overlapping gene ) • 定义 – 是指两个或两个以上的基因共有一段 DNA序列,或是指一段DNA序列成为 两个或两个以上基因的共同组成部分。 • 发现 – 1978年Sanger分析了ΦX174DNA全序 列后,发现它由5386个核苷酸组成, 共9个基因,编码2000个氨基酸 Phi X174 的基因重叠 5386Nt;11ORF;2327AA 位置 氨基酸 功能 3981~53861~136 513 viral strand synthesis 4497~53861~136 341 shut off host DNA synthesis 5075~53861~51 120 capsid morphogenesis 51~221 56 / 133~393 86 DNA maturation 390~848 152 capsid morphogenesis 568~843 91 cell lysis protein 848~964 38 core protein 1001~2284 427 major coat protein 2395~2922 175 major spike protein 2931~3917 328 minor spike

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