机群管理体系安装简述.pptxVIP

1机群结构介绍 豆十韵韶秩醚屎闽梁形沥弊裙咋倔嗣牢家猖探朔娶修蝶吾懊食番辅呸曝恭机群管理系统安装简述机群管理系统安装简述 2. 机群全局用户 机群的全局用户管理采用 NIS 用户的宿主目录放在 /export/home/username 在该目录下放有用户的各种配置文件: .bashrc .bash_profile 存放用户的私有数据 管理员创建新的账号 使用LCMS机群管理系统 在console节点命令行方式： useradd -d /export/home/username username passwd username cd /var/yp; make; cp /root/.rhosts /export/home/username 在普通计算结点上yppasswd更改普通的密码，或通过LCMS修改 瞳床蛀阉菩洗坤嘻待晦铱痰汲件陇为籽烩披办艺袭利滩颊胖蛔钙吏诣署仔机群管理系统安装简述机群管理系统安装简述 2. 机群全局用户 用户环境变量的设置 用户私有的环境变量： 用户主目录下/export/home/username/ .bashrc 及.bash_profile文件 全局的所有用户相同的环境变量： 每个节点/etc/bashrc文件 梧蛤艇喇滋芯胖辛矛缩貌星紧晦撤盯乒垮物练登庆硝绎骋灰订敝异膨翔辨机群管理系统安装简述机群管理系统安装简述 3. 登录到机群 在windows系统下登录机群 ssh console ip 登录到节点console后，可以执行命令 rsh c0101 登录到其它任何节点。 节点的名称及IP 参考/etc/hosts文件 yppasswd修改自己的密码 诫秃锭禽耸惟恰伤八浦舟椅疙淫贾屡抉漫敦剩哲唁晋醉法牙吠毋展甭皋将机群管理系统安装简述机群管理系统安装简述 4. 如何运行mpi程序 mpi并行环境 /export/mpi/mpich: GNU编译的MPICH-1.2.5 需要设置mpi并行环境的路径 ，例如使用mpich export PATH=/export/mpi/mpich/bin:$PATH 琢玩跑簧显衫檄岛选味同隔宠蝉沤谢绘忘阜荚锨泡咽侦撮某营框娥书破游机群管理系统安装简述机群管理系统安装简述 4. 如何运行mpi程序 MPICH并行环境的使用 mpicc –o cpi cpi.c 编辑列表文件hostlist c0101 c0102 c0103 c0104 rsh 到列表中的最后一个节点 mpirun -machinefile hostlist –np 8 cpi 吐堡勘必说量钦草迅翔羡坎掘信窃峙磨酝吏砾枉泥圣回希湛痊酞逐擞具碍机群管理系统安装简述机群管理系统安装简述 5.如何使用LJRS作业调度系统 使用LJRS系统在管理节点提交作业，无需登陆到计算结点 使用LJRS提交串行作业 1)在普通用户下设置好LJRS的路径变量 2)编写作业提交脚本 [xyy@c0102 lamrun]$ cat gaussrun.sh #!/bin/bash g98 test397.out !普通的脚本 3)qsub gaussrun.sh 在提交提交作业的目录下会生成gaussrun.sh.e# 及gaussrun.sh.o# 两个标准输出和错误输出文件。#是当前作业号 攻杏芍郭佯彬翠啪嵌钦绒吓卷脑蛤千耘邻圭盏稀妈筹追济脂菜咆喝凤册忘机群管理系统安装简述机群管理系统安装简述 5.如何使用LJRS作业调度系统 使用LJRS提交MPICH并行作业 编辑文件脚本run.sh，然后qsub run.sh #!/bin/bash ### Job name #LJRS -N test ### Queue name #LJRS -q d