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3第三章 基因工程的工具酶
(二) Klenow酶 该酶无5‘-3’外切活性,保留了5‘-3’聚合活性及3‘-5’外切活性。 基因工程中利用该酶: 修复限制性内切酶造成的5突出的粘性末端 标记DNA探针 催化cDNA第二条链的合成 末端终止法测序 3’ 5’ G A 新链合成方向 5’ C (三) T4 DNA聚合酶 (四)T7 DNA聚合酶 测序酶 (五) Taq DNA聚合酶 耐高温,主要用于PCR反应 DNA聚合酶活性 RNase H活性 DNA内切酶活性 核酸结合活性 (六)依赖于RNA的DNA聚合酶(反转录酶) 反转录酶的基本特性:以RNA为模板聚合cDNA链 3’AAAAAAAAAAAAAA 5’mRNA 5’TTTTTTTTTTTTTTT 3’cDNA 3’AAAAAAAAAAAAAA 5’mRNA 5’TTTTTTTTTTTT oligo (dT) 12-18 反转录酶 Mg2+dNTP * * 第三章 基因工程的工具酶 第一节 基因工程的工具酶 第二节 DNA的切割反应 第一节 基因工程的工具酶 一、限制性内切酶(Endonucleosase) 二、 T4-DNA连接酶(T4-DNA Ligase) 三、核酸酶 四、聚合酶 五、 DNA修饰酶 一、限制性核酸内切酶(Endonucleosase) (一)限制性内切酶的发现与分类 1)限制-修饰系统: 细菌能将外来DNA片段在某些专一位点上切断,从而保证其不为外来噬菌体所感染,而其自身的染色体DNA由于被一种特殊的酶所修饰而得以保护,这种现象叫做限制-修饰。 2)限制性核酸内切酶的类型 主要特性 I 型 II 型 III 型 限制修饰 多功能 单功能 双功能 蛋白结构 异源三聚体 同源二聚体 异源二聚体 辅助因子 ATP Mg2+SAM Mg2+ ATP Mg2+SAM 识别序列 TGAN8TGCT 旋转对称序列 GAGCC AACN6GTGC CAGCAG 切割位点 距识别序列1kb处 识别序列内或附近 距识别序列下游 随机性切割 特异性切割 24-26bp处 (二)II类限制性内切酶的命名及特性 命名原则 Haemophilus Influenzue d 嗜血流感杆菌d株 属名 种名 株名 H i n d III H i nd III 同一菌株中所含的多个不同的限制性核酸内切酶 (三)II类限制性内切酶的底物识别顺序及切割位点 几种最常用的限制性核酸内切酶 G↓GATCC AT↓CGAT G↓AATTC A↓AGCTT GTPy↓PuAC GGTAC↓C GC↓GGCCGC CTGCA↓G G↓TCGAC ↓GATC GGCCNNNN↓NGGCC CCC↓GGG T↓CTAGA C↓TCGAG BamHⅠ Cla Ⅰ EcoR Ⅰ Hind Ⅲ HindⅡ KpnⅠ Not Ⅰ Pst Ⅰ Sal Ⅰ Sau3A Ⅰ Sfi Ⅰ Sma Ⅰ Xba Ⅰ Xho Ⅰ 识别序列和切割点 限制性核酸内切酶名称 二、T4-DNA连接酶(T4-DNA Ligase) 来源于T4噬菌体感染的大肠杆菌,连接修复3‘端羟基和5’端磷酸基因,脱水形成3‘-5’磷酸二酯键。 三、核酸酶 作用:降解磷酸二酯键 分为:外切酶 内切酶 (一) Bal 31(来自于细菌 Alteromonas espejiana) 单链特异内切,双链特异外切,依赖于Ca2+ 用途: 构建限制酶图谱 产生末端缺失突变 DNA超螺旋线性化 (二)E. coli外切酶III 只降解DNA分子的一条链,产生单链的DNA分子。 (三)S1核酸酶(来源于米曲霉菌) 特性: 1. 降解单链DNA或RNA,降解DNA的速度大于降解RNA的速度 2. 降解发生的方式为内
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