hmg-coa还原酶抑制剂的3d-qsar研究基于分子对接和flexs的叠合 3d-qsar study of hmg-coa reductase inhibitorsbased on molecules docking and superimposion of flexs.pdfVIP
- 1、本文档共5页,可阅读全部内容。
- 2、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
- 3、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载。
- 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
- 5、该文档为VIP文档,如果想要下载,成为VIP会员后,下载免费。
- 6、成为VIP后,下载本文档将扣除1次下载权益。下载后,不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
- 7、成为VIP后,您将拥有八大权益,权益包括:VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
- 8、VIP文档为合作方或网友上传,每下载1次, 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等,对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
查看更多
hmg-coa还原酶抑制剂的3d-qsar研究基于分子对接和flexs的叠合 3d-qsar study of hmg-coa reductase inhibitorsbased on molecules docking and superimposion of flexs
第26卷第lO期 计算机与应用化学 V01.26,No.10
2009年lO月28日 and Chemistry October,2009
ComputersApplied
HMG-CoA还原酶抑制剂的3D-QSAR研究:
基于分子对接和FlexS的叠合
吴萍1,孔德信2+
(1.山东理工大学化学工程学院,山东,淄博,25509l;
2.山东省生物信息工程技术研究中心,山东理工大学生命科学学院,山东,淄博,255091)
摘要:HMG-CoA还原酶是降血脂药物设计的重要靶标,抑制该酶的活性可以有效地降低血浆总胆固醇水平,从而降
低心脑血管疾病的发病几率。拜斯亭事件以后,他汀类药物的安全性特别是长期服用的安全性一直备受关注,所
以,设计新型安全的HMGR抑制剂仍然f分迫切。本文利用已经建立的分子对接模型对接文献中已经报道的几组
HMGR抑制剂分子,确定这些分子可能的结合构象。然后,利用比较分子力场分析(CoMFA)和比较分子相似性指数
(10组CV),对测试集化合物的活性预测结果与实验数据相关性很好,表明模型预测能力较强。分析出三维空间中
QSAR研究中分子对接和分子场的霍合。
关键词:HMGR抑制剂;CoMFA;CoMSIA;3D—QSAR
6-39
中图分类号:O641;TQ015。9;0 文献标识码:A
1 引言 2研究方法
还原酶3-羟基_3-甲基戊二酰辅酶A(3-hydroxy-3-meth·
2.1选择化合物组、确定活性构象和叠合方式
ylglutaryl—coenzymeA(HMG—CoA)Reductase,HMGR)是胆
HMGR抑制剂活性测试结果有多种表示方法,而且由于
固醇合成中的第一关键酶,也是调节体内胆固醇合成速度的 测试的条件不同,不同研究组、不同活性测试方式的结果一
天然调控酶。抑制HMGR的活性能减少或阻断体内胆固醇般可比较,因此,QSAR研究中选择化合物组十分莺要。本
的合成,达到防治高脂血症和动脉粥样硬化的目的。目前已 文从文献中选择了75种化合物【7“…,合成和活性测试由同
经上市的他汀类药物临床疗效和耐受性均较好,但是由于使
用人群巨大,他汀类药物的安全性,特别是拜斯亭事件后,长
[一log(IC∞)]表示,活性范围分布均匀,适于研究定量构效
期服用的安全性一直备受关注,所以,设计新型安全的 关系。它们的结构通式如图1所示,化合物的编号按照文献
HMGR抑制剂仍然十分迫切¨。2J。
ofMedcial
来源,JMC为Journal cheIIli8try的缩写,其后为首
大量活性化合物的报道,为建立高预测能力的定量构效
关系模型提供重要信息,但是,由于缺乏晶体结构的支持,以
前的QSAR研究没有考虑到蛋白质的结构H。J,可靠性有
有10种)。化合物的结构采用$YBYL程序构建,赋
限。前文我们报道了HMGR虚拟筛选(分子对接)模型的构
建陋1,本文利用该对接模型确定了几组化合物的叠合方式。
8
限为0.041kJ/mol·A。分子的活性构象和叠合方式由
通过CoMFA、CoMSlA研究它们的定量构效关系,为设计新
您可能关注的文档
- dna自组装计算模型求解二部图完美匹配问题 the dna self-assembly computing model for solving perfect matching problem of bipartite graph.pdf
- eadeeg能量感知的无线传感器网络数据收集协议 eadeeg an energy-aware data gathering protocol for wireless sensor networks.pdf
- easiars:多模通信传感网的动态wifi链路接入及自适应组网方法 easiarsdynamic wifi link access and adaptive networking based on multi-mode communication in wireless sensor networks.pdf
- efsm的组态化应急演练推理系统设计 design of the efsm configurable emergency drill inference system.pdf
- en-route transcoding缓存的优化放置和替换 optimal placement and replacement scheme in en-route transcoding caching systems.pdf
- esn岭回归学习算法及混沌时间序列预测 ridge regression learning in esn for chaotic time series prediction.pdf
- etl的符号化模型检验 symbolic model checking of etl.pdf
- fastgen一种新颖的混合的结构产生算法 fastgen a novel hybrid structure generation algorithm.pdf
- fatman:building reliable archival storage based on low-cost volunteer resources.pdf
- facial-lighting归一化方法研究 research on facial-lighting normalization methods.pdf
- 中国国家标准 GB/T 4706.93-2024家用和类似用途电器的安全 第93部分:商业用湿式和干式真空吸尘器,包括动力刷的特殊要求.pdf
- 《GB/T 4706.93-2024家用和类似用途电器的安全 第93部分:商业用湿式和干式真空吸尘器,包括动力刷的特殊要求》.pdf
- 中国国家标准 GB/T 4706.32-2024家用和类似用途电器的安全 第32部分:热泵、空调器和除湿机的特殊要求.pdf
- GB/T 4706.32-2024家用和类似用途电器的安全 第32部分:热泵、空调器和除湿机的特殊要求.pdf
- 《GB/T 4706.32-2024家用和类似用途电器的安全 第32部分:热泵、空调器和除湿机的特殊要求》.pdf
- GB 2099.7-2024家用和类似用途延长线插座 安全技术规范.pdf
- 中国国家标准 GB 2099.7-2024家用和类似用途延长线插座 安全技术规范.pdf
- 《GB 2099.7-2024家用和类似用途延长线插座 安全技术规范》.pdf
- GB/T 4706.100-2024家用和类似用途电器的安全 第100部分:多功能淋浴房的特殊要求.pdf
- 中国国家标准 GB/T 4706.100-2024家用和类似用途电器的安全 第100部分:多功能淋浴房的特殊要求.pdf
文档评论(0)