未培养微生物的培养方法进展-应用与环境生物学报.PDF

2016-06-25 DOI: 10.3724/SP.J.1145.2015.09023 / Chin J Appl Environ Biol 2016 22 ( 3 ) : 0524-0530 应用与环境生物学报 ， 未培养微生物的培养方法进展* ** 范念斯 齐嵘 杨敏 中国科学院生态环境研究中心，环境水质学国家重点实验室 北京 100085 摘 要 在自然界庞大的微生物资源中，传统条件下可分离培养的微生物仅占 1%，绝大多数则是尚未在人工条件下 Uncultured microorganism In 获得生长活性的未培养微生物（ ）. 未培养微生物的难培养在于无法全面掌握它们原位（ situ ）生长的环境信息及在人工条件下的准确复制，从而阻碍了环境微生物的特性研究和资源开发. 本文详细介绍了 目前对未培养微生物原位生长信息的主要认知及限制实现条件，系统总结了当今未培养微生物的最新培养方法进 展. 以新型培养基、高通量和微流控等为代表的各种新型培养装置与技术的应用，显著提高了未培养微生物的分离 及培养效率，分离出不同环境中的多种未培养微生物，例如肠道细菌 Ruminococcaceae、浮游细菌Formosa和土壤细菌 Candidate N. defluvii等. 分子生物学技术在近十几年快速发展和广泛应用，特别是通过高通量测序和宏基因组测序， 在基因功能水平上探索微生物代谢途径和生理生化机制的研究，为快速寻找适宜人工培养条件、规避传统方法的长 周期弊端提供了可能. 总之，新培养技术的出现显著提高了微生物的可培养比例，基于分子生物学方法的研究结果不 仅大大丰富了微生物资源库，为种群多样性的深入研究及在生态系统中的作用奠定了良好的基础，更是为今后微生 物分离与培养技术的提高指出了明确方向. （图2 参 60） 关键词 环境微生物；未培养微生物；限制因素；培养方法；分子生物学技术 CLC Q93-335 : Q78 Current technical progresses in the cultivation for uncultured microorganism* FAN Niansi, QI Rong** YANG Min Research Centre for Eco-Environmental Sciences, Chinese Academy of Sciences, State Key Laboratory of Environmental Aquatic Chemistry, Beijing 100085, China Abstract Only 1% of the natural microorganisms can be artificially isolated and cultured. The large quantity of uncultured microorganisms, the microbes that cannot be kept alive in artificial conditions, is therefore a vast reservoir of natural microorganism resources. One of the major obstacles for further research on these uncultured microorganisms lies in understanding the in situ surviving environmental essentials and precisely duplicating them in the lab condit