空肠弯曲杆与菌分子生物学鉴定.pptVIP

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  • 2017-10-18 发布于浙江
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空肠弯曲杆与菌分子生物学鉴定

空肠弯曲杆菌分子生物学检测方法研究进展 一、空肠弯曲杆菌简介 二、DNA环介导恒温扩增法 三、DNA环介导恒温扩增法检测空肠弯曲 杆菌 四、研究意义 五、前人研究进展 六、拟解决的关键问题 一、空肠弯曲杆菌简介 空肠弯曲杆菌(Campylobacter jejuni, C. jejuni)作为一种食源性人畜共患病的病原体,越来越受到国内外高度重视。 近年来,空肠弯曲杆菌感染率在世界各地普遍呈上升趋势。 空肠弯曲杆菌系弯曲杆菌属的一个种,弯曲杆菌属细菌分为两类:一类是25℃生长,42℃不生长的细菌;另一类为25℃不生长,42℃生长的细菌。 空肠弯曲杆菌在弯曲杆菌属中最为常见,是引起人类细菌性胃肠炎的主要病原菌之一。 空肠弯曲杆菌为多形性,呈弧形,螺旋形、海鸥展翅形或S形。革兰氏染色阴性。 空肠弯曲杆菌在外环境下的存活力取决于温度,4℃时在水、粪便、尿、牛奶中可存活几周,25℃时只能存活几天或更短的时间。对热敏感,58℃经过5分钟即可杀灭,另外阳光直射及消毒剂也有很好的杀灭效果。 空肠弯曲杆菌为微需氧菌,在大气或厌氧的环境中不能生长。 空肠弯曲杆菌作为共生菌大量存在于各种野生或家养动物的肠道内,与人体感染较为密切的主要为家畜和家禽,家禽已从鸡、鸭、鹅、火鸡等家禽的粪便、胆汁、泄殖腔内容物中分离到该菌,感染率高,带菌期长,可长达18个月。 分子生物学检测方法 常规生化检测方法 血清学方法 PCR方法(定性PCR方法 荧光定量PCR方法) 环介导恒温扩增法 二、DNA环介导恒温扩增法 DNA环介导恒温扩增(LAMP)反应,是分子生物学领域中的一个新概念,它可以在恒温(60~65℃)条件下,30~60min内将只有几个拷贝的靶核酸扩增到10⒐水平 该方法的一大特色是,可以通过反应副产物——白色焦磷酸镁沉淀的产生与否判断靶基因的存在。 DNA环介导恒温扩增用于病原微生物(如空肠弯曲杆菌)的鉴定具有高效率、高特异性、高敏感性等特点。 LAMP方法在食品安全检测、流行性病毒检测、临床诊断等领域的应用及研究均有文献报道。 LAMP方法已具有成功应用的现实性,为快速基因的检测提供了一种新的技术途径,比PCR方法更具推广性,可望作为常规检测的工具。 2000年,Notomi等开发出一种新的DNA环介导的恒温扩增法(loop-mediated isothermal amplification of DNA, LAMP)。 LAMP方法利用Bst大片段DNA聚合酶和根据不同靶序列设计的两对特殊的内引物(FIP由F1C和F2组成;BIP由BIC和B2组成)、外引物(F3和B3),特异地识别靶序列上的6个独立区域。 FIP引物的F2序列与靶DNA上互补序列配对,启动循环链置换反应。F3引物与模板上的F3C区域互补,引起合成与模板DNA互补的双链,从而挤掉FIP引起的DNA单链。 与此同时,BIP引物与被挤掉的这条单链杂交结合,形成的环状结构被打开,接着,B3引物在BIP外侧进行碱基配对,在聚合酶的作用下形成新的互补链。 被置换的单链DNA两端均存在互补序列,从而发生自我碱基配对,形成类似哑铃状的DNA结构。LAMP反应以此DNA结构为起始结构,进行再循环和延伸,靶DNA序列大量交替重复产生,形成的扩增产物是有许多环的花椰菜形状的茎-环结构的DNA,数量级可达10⒐ DNA环介导恒温扩增反应原理示意图 LAMP方法特点 扩增反应易进行和扩增产物方便、快捷鉴别 LAMP反应特异性强、灵敏度高 实验装置简单 三、DNA环介导恒温扩增法检测空肠弯曲杆菌 拟建立一种DNA环介导恒温扩增法来检测空肠弯曲杆菌 与PCR扩增方法类似,根据反应的副产物是白色焦磷酸镁沉淀,可肉眼观察,来鉴定反应是否进行。 LAMP扩增产物可以像PCR反应一样利用凝胶电泳并结合成像系统进行检测。 利用LAMP方法检测空肠弯曲杆菌,不仅可以对反应结果进行定性,而且还可以通过利用焦磷酸镁沉淀的产生量与DNA的生成量之间的线性关系,对反应的DNA进行定量。 四、研究意义 预防和控制空肠弯曲杆菌病在我国的流行,不但具有重要的经济意义,更重要的是将在我国社会发展中起重要作用,具有重大的社会意义。只有对空肠弯曲杆菌流行分布状况进行全面系统地调查研究,搞清其感染率和发病率,掌握其耐药谱,才能准确地预测其流行趋势。 空肠弯曲杆菌广泛存在于动物机体,很容易对集约化养殖中普遍应用的抗菌药物产生耐药性,且这种耐药性很容易通过食物等途径转移给人类,直接威胁人类健康。因此对空肠弯曲杆菌的检测具有重要的公共卫生学意义。 五、前人研究进展 一般对空肠弯曲杆菌的检测大多采用PCR方法。 利用DNA环介导恒温扩增法检测了如金黄色葡萄球菌、沙门氏菌、志贺杆菌、李斯特菌等,前人均有文献报道。 王福厚等

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