秀丽线虫.pptVIP

* * 小线虫，大发现 2012年12月12日 一、背景介绍 二、全基因组测序 三、基因功能注释 一、背景介绍 20世纪60年代，分子遗传学的奠基人之一Sydeney Brenner[1]在和Crick等人一起确立了分子遗传学的中心法则以后，感到分子生物学的主要问题已经解决，生物学的未来应着眼于发育生物学和神经生物学等复杂问题的研究。 Brenner试图寻找一种比果蝇更简单的、具有神经细胞的多细胞生物来探索个体及神经发育的遗传调控机制。在经过了一系列尝试后，他选择了秀丽线虫（C. elegans）为研究对象。在此之前，Nigon和Dougherty[2]等已经在秀丽线虫的营养生长和有性生殖方面做了许多前期工作。 （一）生物学特征 1.学名：Caenorhabditis elegans,简称为：C.elegans 2.线形动物门，小杆亚纲，小杆目，小杆总科，隐杆线虫属 3.它生活在世界各地的泥土中，以细菌为食，其生命周期大约为3d，平均寿命为3周。成虫呈蠕虫状，长约1mm左右，身体直径约30μm。 4.幼虫含有556个体细胞和2个原始生殖细胞，成虫则根据性别不同具有不同的细胞数。雌雄同体成虫含有959个体细胞，约2000个生殖细胞，而雄性成虫则具有1031个体细胞和1000个生殖细胞。 5.秀丽线虫有两种性别：雌雄同体和雄性。 雌雄同体可进行自我繁殖，也可与雄性交配繁殖；与雄性交配的后代，50%是雌雄同体，50%为雄性。自我繁殖的大多是雌雄同体，雄性个体以很低的频率自发产生。一条未经交配的雌雄同体在生殖期可产生约300个后代。若与雄性个体交配则产生多达1000个。 6.秀丽隐杆线虫有5对常染色体和1对性染色体。 7.实验研究中通常用的是：N2野生型秀丽隐杆线虫(C.elegans, the Bristol strain N2)。 (二)作为模式生物的优势 1.取材容易，成本低廉 2.易于培养和保存 培养可选用NGM培养基[3]，保存可用M9缓冲液洗净虫体后放入30%甘油中，于-80℃保存[4]；或将虫体置于30%甘油溶液于液氮中长期保存[1]。 3.发育周期短，且多产 许多实验结果在1~2周，甚至几天即可获得。 4.全身透明，易于观察 它是唯一一个身体中所有细胞能被逐个盘点并各归其类的生物。20世纪90年代中期，人们已建立从受精卵到所有成体细胞的线虫完整谱系图[5]。在研究细胞谱系过程中，Sulston发现线虫的全部细胞（1090个）中的131个细胞以一种不变的方式在固定的发育时间和固定位置消失，此现象即细胞程序性死亡。 5.基因组全序列已知且容量小，可操控性强 6.实验操作方便简单，且实验规模易放大 线虫体径30μm,24孔板上的一个孔内可固体或液体培养上百条线虫，化合物筛选可放大到96孔[6]，384孔[7]，甚至1536孔平板[8]。 （三）应用研究领域 自Brenner开始，四十多年来，以秀丽线虫为模式生物的研究几乎涉及到生命科学的各个领域并取得了重大突破，如MAPK信号转导、细胞程序性死亡、TGF-?信号传递途径、RNA干扰（RNAinterference,RNAi）和微RNA(microRNA,mRNA)、衰老及脂肪代谢等。 其中最杰出的成果是： 2002年，Brenner和Horvitz、Sulston对器官发育的遗传基础及程序性细胞死亡基因调控机制的揭示，荣获了诺贝尔生理医学奖 Sydney Brenner H. Robert Horvitz John E. Sulston 2006年，安德鲁·法尔和克雷格·梅洛获得诺贝尔生理医学奖，以表彰他们发现了RNA干扰现象。 Andrew Z. Fire Craigc. Mell 二、全基因组测序 1998年，秀丽隐杆线虫的基因组序列测序完成，准确率达99%，剩下的1%的缺口也于2002年10月完成。秀丽隐杆线虫基因组大小为9.7×107碱基，编码1.9万个基因，大约是大肠杆菌基因组的20倍，人类的1/30。编码序列占整个基因组的27%，平均每个基因有5个内含子。基因组序列40%与人类同源[9]。 秀丽隐杆线虫是人类第一次完成的多细胞动物基因组序列测