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- 2017-10-25 发布于北京
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海州香薷不同种群细胞壁转化酶蛋白结构与分子模拟对接
摘要:为研究铜胁迫下海州香薷(Elsholtzia haichowensis Sun)非矿区种群?胞壁转化酶(EhNcwINV)和矿区种群细胞壁转化酶(EhCcwINV)活性差异的机理,运用在线分析工具对细胞壁转化酶基因推导的氨基酸序列进行分析,利用SWISS-MODEL进行同源建模,并将细胞壁转化酶与蔗糖分子进行模拟对接。结果表明,海州香薷两个种群细胞壁转化酶蛋白质在443位点和538位点处存在氨基酸趋异位点,模拟的3D结构非常相似,仅在趋异位点Leu433/Pro433和Tyr538/His538处有差别。EhNcwINV、EhCcwINV和模拟突变体(EhNcwINV-L433P和EhNcwINV-Y538H)与蔗糖分子对接形成的催化活性中心构象基本一致,但在空间位置上存在细微差异,氨基酸趋异可能是造成两个种群细胞壁转化酶活性差异的原因之一。
关键词:海州香薷(Elsholtzia haichowensis Sun);细胞壁转化酶;同源建模;分子对接
中图分类号:Q51;Q942.7 文献标识码:A 文章编号:0439-8114(2017)01-0166-05
DOI:10.14088/ki.issn0439-8114.2017.01.042
Protein Structure and Mole
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