武汉大学分子模拟实验作业第十章过渡态的优化.docxVIP

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2017-10-25 发布于重庆
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武汉大学分子模拟实验作业第十章过渡态的优化.docx

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武汉大学分子模拟实验作业第十章过渡态的优化

10-3-1采用GAMESS, HF/6-31G(d)计算反应物：气相：Total Energy = -313185.421886 Kcal/Mol溶剂化：Total Energy = -320855.0145 Kcal/Mol气相：Total Energy = -62343.3171 Kcal/Mol溶剂化Total Energy =-62460.3983 Kcal/Mol反应物总能量：气相-313185.421886 Kcal/Mol+（-62343.3171 Kcal/Mol）=-375528.7389 Kcal/Mol溶剂化后： -320855.0145 Kcal/Mol+（-62460.3983 Kcal/Mol）=-383315.4128Kcal/Mol中间体1气相： Total Energy = -375552.4562 Kcal/Mol溶剂化： Total Energy = -544300.1875 Kcal/Mol过渡态气相：E= -375530.237194 Kcal/Mol溶剂化：E= -538290.9905 Kcal/Mol中间体2气相：E= -375611.0735 Kcal/Mol溶剂化：Total Energy = -544428.1875 Kcal/Mol产物：气相：Total Energy = -87245.465945 Kcal/Mol溶剂化Total Energy = -87270.0137 Kcal/Mol气相：energy = -288356.67816 Kcal/Mol溶剂化 energy = -288473.7594 Kcal/Mol产物总能量：气相：-87245.465945+（-288356.67816）=-375602.1236 Kcal/Mol溶剂化后：-87270.0137 +( -288473.7594)=-375743.7731Kcal/Mol气相反应势垒溶剂化反应势垒采用Mopac，PM3方法计算反应物：气相：Total Energy = -11108.6433 Kcal/Mol溶剂化：Total Energy = -11109.9208 Kcal/Mol气相：Total Energy = -10139.2662 Kcal/Mol溶剂化：Total Energy = -10234.6847 Kcal/Mol反应物总能量：气相：-11108.6433+（-10139.2662）=-21247.9095 Kcal/Mol溶剂化后：-11109.9208+（-10234.6847）=-21344.6055 Kcal/Mol中间体1：气相：Total Energy = -21258.0499 Kcal/Mol溶剂化:Total Energy = -21340.9771 Kcal/Mol过渡态：气相：Total Energy = -21252.5012 Kcal/Mol溶剂化：Total Energy = -21320.1352 Kcal/Mol中间体2：气相：Total Energy = -21313.8820 Kcal/Mol溶剂化：Total Energy = -21386.9799 Kcal/Mol产物：Total Energy = -13958.4182 Kcal/Mol溶剂化Total Energy = -13959.8811 Kcal/Mol气相：Total Energy = -7348.6109 Kcal/Mol溶剂化：Total Energy = -7428.9169 Kcal/Mol产物总能量：气相：-13958.4182+（-7348.6109）=-21307.0291 Kcal/Mol溶剂化后：-13959.8811+（-7428.9169）=-21388.7980 Kcal/Mol气相反应势垒溶剂化反应势垒过渡态的优化甲酸和水分子形成的络合物的构型优化------------- GAMESS Interface ------------GAMESS Job: Minimize (Energy/Geometry) UHF/6-31G(d)Finish @ energy = -166150.964067 Kcal/Mol (-264.778634 Hartrees)------------------------------------------尿素和水形成氢键------------ GAMESS Interface ------------GAMESS Job: Minimize (Energy/Geometry) UHF/6-31G(d)Finish @ energy = -188258.689979 Kcal/Mol (-300.0