近似贝叶斯法在光合模型参数估计中的应用-植物生态学报.PDFVIP

植物生态学报 2017, 41 (3): 378–385 doi: 10.17521/cjpe.2016.0067 Chinese Journal of Plant Ecology 近似贝叶斯法在光合模型参数估计中的应用 1 2* 1 曾继业 谭正洪 三枝信子 1 日本国立环境研究所, 筑波 305-8506, 日本; 2海南大学环境科学系, 海口 570228, 中国 摘 要 长期以来, 光合作用机理模型中参数的确定都是一个难点。该文提出一种参数反演的方法, 称为近似贝叶斯法 (APMC), 用来确定Farquhar光合模型的生理参数。通过将整个冠层抽象为一片大叶的思维抽象, 笔者进一步将APMC应用到 冠层尺度的生理参数求解, 使直接求算冠层尺度生理参数成为可能。该文详细介绍了使用APMC估算光合模型参数的具体算 法, 并用实测数据进行了验证。结果表明, APMC可以很好地应用于冠层光合模型参数的估计, 估计所得的参数落在参数生理 上下限值之间, 应用1 948个实测数据进行检验, 得到决定系数0.75 。模拟值和实测值的线性回归曲线斜率为1.04, 与理论上的 1.0非常接近。这个方法对光合模型参数的获取或许有积极的意义。 关键词 蒙特卡洛; 大叶模型; Farquhar光合模型; 净生态系统交换 引用格式: 曾继业, 谭正洪, 三枝信子 (2017). 近似贝叶斯法在光合模型参数估计中的应用. 植物生态学报, 41, 378–385. doi: 10.17521/cjpe.2016.0067 Using approximate Bayesian computation to infer photosynthesis model parameters 1 2* 1 ZENG Ji-Ye , TAN Zheng-Hong , and SAIGUSA Nobuko 1National Institute for Environmental Studies, Tsukuba 305-8506, Japan; and 2Department of Environmental Science, Hainan University, Haikou 570228, China Abstract We developed a method, namely Adaptive Population Monte Carlo Approximate Bayesian Computation (APMC), to estimate the parameters of Farquhar photosynthesis model. Treating the canopy as a big leaf, we applied this method to derive the parameters at canopy scale. Validations against observational data showed that parameters estimated based on the APMC optimization are un-biased for predicting the photosynthesis rate. We conclude that APMC has greater advantages in estimating the model parameters than those of the conventional nonlinear re- gression models. Key words Monte Carlo; big-leaf model; Farquhar photosynthesis model; net ecosystem exchange Citation: Zeng JY, Tan ZH, Saigusa N (20