(生物信息学)华大基因生物信息学导论.pdf

生物信息学导论 林钊 linzhao@genomics.org.cn “We are swimming in a rapidly rising sea of data...how do we keep from drowning? ” Science ，Bioinformatics- Trying to Swim in a Sea of Data 什么是生物信息 “生物信息学是包含生物信息的获 取、处理、贮存、分发、分析和解释 的所有方面的一门学科，它综合运用 数学、计算机科学和生物学的各种工 具进行研究，目的在于了解大量的生 物学意义。” HGP第一个五年总结报告 * HGP：人类基因组计划，1990-2003 生物信息学分类 DNA RNA 研究主体 、 、蛋白质、多糖、其他小分子 研究方向 数据库、软件、算法 研究对象 动植物、人、微生物 应用领域 教育、医药、健康、农业、工业、能源 涵盖学科 生物学、计算机编程、物理学、数学、化学、信息科学 SNP 数据基本处理及拼接组装、基因预测和注释、 的发 研究手段 现与鉴定、非编码区信息结构分析、比较基因组学研究、 基因功能表达谱的分析、进化分析 生物信息学发展史 萌芽 形成 发展 当代 萌芽 萌芽 形成 发展 当代 DNA双螺旋和中心法则 双螺旋的发现，1953 中心法则的发现，1958 沃森（左）和克里克 克里克 计算机在生物信息中的作用 0 A T Vs. C 1 G 第一台商用计算机，1951 J. Presper Eckert 和John Mauchly。 1956年，在美国田纳西州 Gatlinburg 召开首次 “生 物 学中的 信息 理论研讨 会”。 “蛋白质序列与结构图册” Margaret Dayhoff 1961年，建立蛋白质序列与 结构图册,这一蛋白质数据库 后来成为著名的蛋白质信息 源PIR Needleman-Wunsch Algorithm 1970年 全局比对算法 测序方法 萌芽 形成 发展 当代 形成 萌芽 形成 发展 当代 三大数据库 “国际DNA序列数据库合作计划” clustal、fasta、blast Smith-Waterman算法 谁是真正的“生物信息学之父”？ 问题：生物信息学教科书中一般 导论中生物信息学一词是谁发明 的？ 没有提到；