流感病毒神经氨酸酶抑制剂的理性筛选.PDF

维普资讯 第21卷 第2期 计算机 与应用化学 Vo1．21．NO．2 2004年3月28日 ComputersandAppliedChemist~ March，2004 流感病毒神经氨酸酶抑制剂的理性筛选 刘艾林，杜冠华 (中国医学科学院药物研究所 ，北京 ，100050) 摘要 ：介绍了理性筛选流感病毒神经氨酸酶抑制剂的全过程 ，共分4个阶段 ：1)化合物数据库类药性处理；2)建立 神经氨酸酶抑制剂三维药效 团并对 目标数据库进行构象搜索 ；3)分子对接及对接后分析 ；4)神经氨酸酶抑制模型 的建立及待测化合物的活性检测。活性检测后发现 4个活性化合物 ，其 中 Ic 为 10。M 的化合物 1个 ．Ic，。为 10 M的化合物 2个 ，Ic。为 10 M的化合物 1个。应用理性筛选方法 ，从化合物数据库中挑选出部分化合物进行 神经氨酸酶抑制活性 的筛选 ，减少了药物筛选的盲 目性 ，提高了药物发现的机率。 关键词 ：神经氨酸酶；三维药效团；分子对接；理性药物筛选 中图分类号 ：R927 文献标识码 ：A 文章编号 ：1001-4160(2004)02—177—180 Rationaldrugscreeningonneuramidinaseinhibitorsofinfluenzavirus LIU AiLinandDU GuanHua (InstituteofMateriaMedica，ChineseAcademyofMedicalSciences，Beijing，100050，China) Abstract：Intheprocessoftherationalscreeningonneuramidinase(NA)inhibitorsofinfluenzavirus，therewere4stages： 1)Preparedfordurg—likecompounddatabase；2)Established3DpharmaeophoremodelofNAinhibitorsandsearchedcon formationsinthetargetcompounddatabase；3)Selectedthecompoundsbytheresultofmoleculardockinganddidpost— dockinganalysis．4)EstablishedtheassaymodelofNAinhibitorandassayedthecompoundsselected．Intheand，we found4 activitycompoundsbyapplyingthe rationalscreeningmethod．Therewereonecompoundwith ICs010一M ，two compoundswithIC5o10～M andonecompoundwithIC5o10～M ．Inthisway，only smallpartofcompoundsselectedfrom thedatabaseareassayed，SOrationalscreeningcanincreasethequalityofscreeningcompounds，decreasethewasteofthe compoundresourceandincreasetheprobabilityofdrugdiscovery． Key words：neuramidinase，pharmacophore，moleculardocking，rationaldurgscreening． LiuALandDuGH．Rationaldrugscreeningonneuramidinaseinhibitorsofinfluenzavirus．Computers andAppliedChemistry，2004，21(2)：177—180． 流感病毒侵害人类健康已有相 当长的历 流感病毒不存在 M 蛋 白。 史 ，并且仍是呼吸道疾病的主要病 因。由于流 广谱抗流感病毒药物的靶标是病毒的两个 感病毒抗原容易发生变异，常规的疫苗免疫方 主要表面糖蛋白：红血球凝集素和神经氨酸酶 法不能有效地保护流感病毒对人体的侵害。金