斑马鱼gstm单核苷酸多态性与低温耐受性的相关分析-海洋科学.pdfVIP

斑马鱼 GSTM 单核苷酸多态性与低温耐受性的相关分析 1, 2 1 1 1, 2 1 王 倩 , 尤 锋 , 辛梦娇 , 胡金伟 , 谭训刚 (1. , , 266071; 2. , 100049) 摘要: 为分析谷胱甘肽硫-转移酶M 基因(glutathione S-transferases M, GSTM)与鱼类低温耐受性的相关 性, 本实验运用PCR-SSCP 技术研究了 130 尾斑马鱼(Danio rerio)GSTM 基因 5UTR 、3UTR 和第一内 含子序列的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms, SNPs), 同时分析了筛选到的基因型与其 低温耐受性状的关联性。结果显示, 在其5UTR 区域检测到AB 、BC 、AC 3 种基因型个体, 共A 、B 、 C 3 个等位基因, 其观测杂合度和期望杂合度分别是 1.000 和 0.570, 多态信息含量为 0.472, 所检测 群体在该座位偏离了Hardy-Weinberg 平衡; 第 1 内含子中检测到DD 、DE 和EE 3 种基因型个体, 共 D 、E 两个等位基因, 其观测杂合度和期望杂合度分别为 0.408 和 0.477, 多态信息含量为0.362, 群体 在该座位符合Hardy-Weinberg 平衡。3UTR 区域中没有发现多态性。上述2 个SNP 座位与斑马鱼低温 2 耐受性状的关联分析结果表明, 5UTR 区 3 种基因型与低温耐受性状均没有显著相关性(χ = 4.029, P 0.05) 。而第1 内含子3 种基因型与低温耐受性状显著相关(χ2 = 8.498, P 0.05): DD 基因型在耐低温群 体中占优势(50.00%), 并表现为对受低温胁迫斑马鱼的保护性因素(OR = 0.520, 95% CI = 0.255–1.061), 而 DE 基因型在不耐低温群体中占优势(51.31%), 表现为低温胁迫下斑马鱼的危险因素(OR = 3.012, 95% CI = 1.413–6.419) 。研究结果为 GSTM 基因 SNPs 位点与斑马鱼低温耐受性能关联分析提供了依据, 也将为海水经济鱼类抗寒标记筛选育种提供参考。 关键词: 斑马鱼(Danio rerio); GSTM; PCR-SSCP; SNPs; 低温耐受相关 中图分类号: Q347 文献标识码: A 文章编号: 1000-3096(2015)01-0001-07 doi: 10.11759/hykx20140304002 , [1] , , , , ,  , [9-10] , [2] GST [11-12], , GSTM , [13] , (Cirrhinus molitorella)[14](Oreoch