$ 种烟草基因组 amp; 位点信息分析和标记开发.PDF

西北植物学报 文章编号 种烟草基因组 位点信息分析和标记开发 童治军肖炳光 云南省烟草农业科学研究院烟草行业烟草生物技术育种重点实验室国家烟草基因工程研究中心昆明 摘 要利用生物信息学方法对绒毛状烟草林烟草和本塞姆氏烟草 份烟草野生种基因组数据中的 位点信 息进行了分析结果表明在全长分别为 和 的绒毛状烟草林烟草和本塞姆氏烟草基 因组中分别获得 个 个和 个 位点平均相隔 和 出现一个 在 位点分布区域上绝大部分的 位点分布在内含子和 尤其是 区域在 基序类 型上主要集中在二三碱基基序且二者占总 位点数目的以上并以二碱基基序类型丰度最高在 基 序结构上基因组中出现频率及数量最高的是含有 的基序结构在 基序的重复次数上除单碱基基序 类型外重复次数多在 次之间利用分别属于 个不同烟草组的 份烟草材料验证所合成的 对引物所 有合成的引物均能扩增获得目标片段其中有 对引物存在扩增多态性表明来源于绒毛状烟草林烟草和本塞 姆氏烟草基因组的 标记在亲缘关系相对较近的烟草种间具有高度保守性和通用性基于此 份烟草野生种基 因组数据开发 引物用于后续的相关遗传研究具有可行性 关键词绒毛状烟草林烟草本塞姆氏烟草基因组 中图分类号 文献标志码