藻类基因组研究进展与est技术的应用-海洋科学.pdfVIP

藻类基因组研究进展与 EST 技术的应用 Progress of algal genome research and appl ication of EST tech nology 1 2 2 1 方永军 ,范晓蕾 ,王广策 ,胡松年 ( 1. 浙江大学 沃森基因组科学研究院 ,浙江 杭州 3 10008 ;2 . 中国科学院 海洋研究所 ,山东 青岛 26607 1) 中图分类号 :Q943 . 2 　　　　文献标识码 :A 　　文章编号 (2007) ( ) 　　藻类在自然界中广泛存在 , 目前已知大约有 3 万余 同 ,却具有基本相同的2c DN A 2 倍染色体组 含量 , 种 。主要生长在水中、潮湿的岩石上、墙壁、树干上及土 证实染色体数 目变异是由于融合或断裂而来 ,而不是 壤表面 。它们对环境条件要求不高 ,适应能力强 , 是新 通过整条染色体丢失或获得产生的。 生活区的先锋植物之一。藻体千差万别 ,小至几微米 , 随着分子生物技术的发展 ,越来越多的物种包括 大至几十米 ,结构简单 ,无根、茎、叶分化 ,一般都具有进 藻类被不同程度地测序 。自 1990 年首次测序了斜生 行光合作用的色素 ,属于自养植物 ,是地球上已知的最 ( ) 栅列藻 S cene des m us obl iquus 线粒体全基 因组序 古老的一个生命类群之一 。有化石记录大约在 35～33 列[4 ] ,到目前已经测序了 45 条藻类线粒体 、叶绿体 、 亿年前 ,地球的水体中就出现了原核蓝藻 ,15 亿年前出 染色体全序列和一个单细胞红藻 Cy ani d ioschy z on 现类似于现代藻类的有机体[ 1] 。 merol ae 10D 的全基因组序列[5 ] 。 藻类与人类的生活生产有着密切的关系 ,可 以 继 Oht a [6 ] 在 2003 年测序了单细胞红藻 C. me r 作为营养食品 ,也可以用作工业原料 ,具有重要的经 ol ae 10D 的质体基因组 ,Mat suzaki 等 2004 年又对其 济价值 ,另一方面它们也可能危害水产养殖业 ,例如 全基因组序列进行了测序 ,也是 目前唯一被完全测序 赤潮[2 ] 。在进化关系上藻类植物跨越了原核和真核 的藻类 。分析发现这种红藻的细胞核中有 20 条染色 两界 ,对于了解生物起源 、演化及机制意义重大 ,是生 体 ,这些染色体 由超过 1 652 万个碱基对组成 ,线粒 物学家共同关注的热点之一[3 ] 。同时对藻类进行分 体和叶绿体中碱基对的数量分别约为 3. 2 万和 15 万 子水平的研究 ,对于改善其经济性状 、减少渔业危害 个 ,找出的 5 331 个基因中有 86. 3 %是表达的,是目前 以及了解地球上生物的进化都有着重要的意义 。 所知的最小的植物基因组 。这种红藻只有生存所必要 的最小限度的基因 ,这为证明哪些是光合真核生物和 1 　藻类基因组研究现状 植物必须的基因提供了重要信息。该物种的基因所含 1. 1 　藻类基因组的研究 的内含子序列少 , 核基 因中有 3 个拷 贝的核糖体 DNA ,缺少肌动蛋白基因。从遗传信息的角度来看 , 藻类染色体数变异较大 , 自 192 1 年 Ishikawa 首