小麦果聚糖合成酶基因sft-a单核苷酸多态性分析及其定位.pdfVIP

中国农业科学 2011,44(11):2216-2224 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2011.11.002 小麦果聚糖合成酶基因6-SFT-A 单核苷酸多态性分析及其定位 1,2 2 2 2 1 2 2 岳爱琴 ，李 昂 ，毛新国 ，昌小平 ，李润植 ，贾继增 ，景蕊莲 1 2 （山西农业大学农学院，山西太谷 030801； 中国农业科学院作物科学研究所/农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程/农业部作物种质资源 利用重点开放实验室，北京 100081） 摘要： 【目的】小麦果聚糖合成酶基因6-SFT 是果聚糖合成过程中的关键酶基因，研究6-SFT-A 的多态性， 分析其与小麦苗期抗旱性的关系，并进行遗传定位。【方法】以苗期抗旱性不同的30 份六倍体小麦和4 份小麦A 基因组供体种乌拉尔图小麦为材料，通过直接测序分析6-SFT-A 的单核苷酸多态性（SNP）及其与抗旱性的关系； 开发基因分子标记，利用RIL 群体（偃展1 号×内乡188）对该基因进行遗传定位。【结果】在30 份六倍体小麦 材料中检测到14 个核苷酸多态性位点，包括13 个SNP 和1 个InDel，平均234 bp 检测到一个多态性位点，仅在 1 727 和 1 781 bp 2 个位点检测到非同义突变；在4 份乌拉尔图小麦中检测到28 个SNP 和4 个InDel，其频率明 显高于普通小麦。该基因的内含子1、2、3 和外显子3 为变异富集区，其它区域变异较小，外显子2 变异最小， π值为0。34 份材料分为3 种单倍型，Hapl Ⅰ主要包括中等抗旱材料和水敏感材料，Hapl Ⅲ中主要包括强抗旱材 料和中等抗旱材料。利用RIL 群体将该基因定位于染色体4A 的标记Xcwm-27 与Xwpt688 之间，遗传距离分别为 5.3 和7.9 cM。【结论】单倍型分析表明，小麦果聚糖合成酶基因6-SFT-A 单倍型与小麦苗期抗旱性有一定的相 关性。 关键词：小麦；6-SFT-A；单核苷酸多态性；抗旱性；单倍型；遗传作图 Single Nucleotide Polymorphism and Mapping of 6-SFT-A Gene Responsible for Fructan Biosynthesis in Common Wheat 1,2 2 2 2 1 2 2 YUE Ai-qin , LI Ang , MAO Xin-guo , CHANG Xiao-ping , LI Run-zhi , JIA Ji-zeng , JING Rui-lian 1 2 ( Agronomy College, Shanxi Agricultural University, Taigu 030801, Shanxi; Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences/National Key Facility for Crop Gene Resources and Genetic Improvement/Key Laboratory of Crop Germplasm and Utilization, Ministry of Agriculture, Beij