高通量转录组测序技术及其在鳞翅目昆虫上的应用-昆虫学报.pdfVIP

昆虫 学 报 高通量转录组测序技术及其在鳞翅目昆虫上的应用 杨 帆 黄立华 张爱兵 首都师范大学生命科学学院 北京 华南师范大学生命科学学院 广州 摘要 转录组是指组织或者细胞在某一特定状态下转录出来的所有的集合 高通量第 代测序技术使转录 组学的研究模式发生了巨大的改变所衍生出的转录组测序迅速成为研究非模式生物的先进技术 转录组测序能 够在整体水平上探究细胞内基因表达的种类和数量揭示在特定条件下机体生理生化发生过程以及其中的分子机 理 本文简要阐述了转录组测序技术的基本概念技术流程与原理详细介绍了转录组测序在解决鳞翅目昆虫的 分类毒理发育与寄主互作以及非编码调控等问题上做出的贡献并对该技术现存的困难进行了系统的阐 述并对其未来的发展趋势作出了简要的预测与剖析 关键词 转录组 转录组测序 高通量测序 数据组装 测序流程 鳞翅目 中图分类号 文献标识码 文章编号 转录组指在某一特定的生长阶段或生理条件 功能 生长 下细胞内所有转录产物的集合 它包括信使 发育 毒理生化 核糖体 转运 以及系统发育 等方面 及非编码 如果能够在最大程度上了解这些 的研究 遗传物质的种类数量转录方式以及剪接模式等信 息并且定量地描述出在不同的特定条件下这些信 转录组研究的主要技术手段 息的区别就可以直观地将某物种基因型和表型建 立联系从而极大地促进我们对细胞内基因组成与 转录组的研究目前主要基于两大类技术手段 基金项目 国家自然科学基金项目 北京市人才强教项目 中华人民共和国科学技术部科技基础性工 作专项重点项目 作者简介 杨帆 女 年生 北京人 博士研究生 研究方向为昆虫遗传多样性及分子生物学 通讯作者 收稿日期 接受日期 昆虫学报 卷 分子杂交与测序技术 分子杂交属于高通量研究中 测序在准确率延长度和性价比三方面都明显优于 相对便宜的实验手段主要利用 碱基互补的 一代测序因此又被广泛应用于转录组的研究中从 原理将提前设计好的探针与具有荧光标记的 而衍生出转录组测序 进行结合利用专门的仪器检测荧光亮度并 一词即利用第 代高通量测序技术全面快速地获 将其转换成数字加以比较 取某一物种特定器官或组织在某一特定状态下所有 例如 的转录本信息 主要包括 和非编码 等 就利用家蚕的芯片与 所获得的海量数据经过专业生物信息软件的比对 感染黑胸败血芽孢杆菌的家 组装等分析后就可以还原出不同时空条件下不同 蚕的转录组杂交通过对杂交信号的分析探究家蚕 组织或细胞中基因表