基于稳定同位素标记和平行反应监测的蛋白质组学定量技术用于-色谱.pdfVIP

２０１７年９月 Ｖｏｌ．３５ Ｎｏ．９ Ｓｅｐｔｅｍｂｅｒ ２０１７ ＣｈｉｎｅｓｅＪｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｃｈｒｏｍａｔｏｇｒａｐｈｙ ９３４～９４０ 研究论文 ＤＯＩ：１０．３７２４／ ＳＰ．Ｊ．１１２３．２０１７．０５０２２ 基于稳定同位素标记和平行反应监测的蛋白质组学 定量技术用于肝癌生物标志物的筛选和验证 王素兰，　 高华萍，　 张　 菁，　 叶　 翔∗ （浙江大学附属邵逸夫医院下沙院区，浙江 杭州 ３１００１８） 摘要：肝癌是全球第五大恶性肿瘤，其五年生存率极低，及早地发现与诊断对肝癌的临床治疗具有重要意义。 通过 结合体外稳定同位素标记的蛋白质组学相对定量技术和基于平行反应监测的靶向蛋白质组学定量技术，建立了一 种癌症生物标志物的筛选和验证方法。 该方法被用于肝癌组织的差异蛋白质筛选和后期验证，共筛选到７０个在 癌组织中显著变化的蛋白质，并对其中７个蛋白质进行了验证。 所验证的蛋白质包括已在临床使用的肝癌标志物 甲胎蛋白（ＡＦＰ）和文献报道的潜在肝癌生物标志物热休克蛋白（ＨＳＰ９０）、脂肪酸结合蛋白５（ＦＡＢＰ５）和乙醇脱氢 酶４（ＡＤＨ４），说明了该方法的可靠性。 该文所筛选的差异蛋白质可以为肝癌生物标志物研究和临床验证提供参 考；该方法还可用于其他癌症样品的差异蛋白质筛选和验证。 关键词：蛋白质组学；稳定同位素标记；平行反应监测；肝癌 中图分类号：Ｏ６５８　 　 　 文献标识码：Ａ　 　 　 文章编号：１０００⁃８７１３（２０１７）０９⁃０９３４⁃０７ Ｓｔａｂｌｅ ｉｓｏｔｏｐｅ ｌａｂｅｌｉｎｇ ａｎｄ ｐａｒａｌｌｅｌ ｒｅａｃｔｉｏｎ ｍｏｎｉｔｏｒｉｎｇ⁃ｂａｓｅｄ ｐｒｏｔｅｏｍｉｃ ｑｕａｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｆｏｒ ｂｉｏｍａｒｋｅｒ ｓｃｒｅｅｎｉｎｇ ａｎｄｖａｌｉｄａｔｉｏｎ ｏｆ ｈｅｐａｔｏｃｅｌｌｕｌａｒ ｃａｒｃｉｎｏｍａ ＷＡＮＧ Ｓｕｌａｎ，ＧＡＯ Ｈｕａｐｉｎｇ，ＺＨＡＮＧＪｉｎｇ，ＹＥ Ｘｉａｎｇ∗ （ＳｉｒＲｕｎＲｕｎ ＳｈａｗＨｏｓｐｉｔａｌＸｉａｓｈａＢｒａｎｃｈ，Ｚｈｅｊｉａｎｇ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｈａｎｇｚｈｏｕ ３１００１８，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｌｉｖｅｒ ｃａｎｃｅｒ ｉｓ ｔｈｅ ｆｉｆｔｈ ｍｏｓｔ ｃｏｍｍｏｎ ｃａｎｃｅｒ ｗｉｔｈ ｅｘｔｒｅｍｅｌｙ ｌｏｗ ｆｉｖｅ ｙｅａｒ ｓｕｒｖｉｖａｌ ｒａｔｅ． Ｅａｒｌｙ ｄｉａｇｎｏｓｉｓ ｉｓ ｏｆ ｇｒｅａｔ ｉｍｐｏｒｔａｎｃｅ ｆｏｒ ｃａｎｃｅｒ ｔｈｅｒａｐｙ． Ｉｎ ｔｈｉｓ ｗｏｒｋ， ｓｔａｂｌｅ ｉｓｏｔｏｐｅ ｌａｂｅｌｉｎｇ⁃ｂａｓｅｄ ｒｅｌａｔｉｖｅ ｑｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅ ｐｒｏｔｅｏｍｉｃｓ ａｎｄ ｐａｒａｌｌｅｌ ｒｅａｃｔｉｏｎ ｍｏｎｉｔｏｒｉｎｇ⁃ｂａｓｅｄ ｔａｒｇｅｔ ｐｒｏｔｅｏｍｉｃｓｗｅｒｅｃｏｍｂｉｎｅｄｆｏｒ ｃａｎｃｅｒｂｉｏｍａｒｋｅｒｓｃｒｅｅｎｉｎｇａｎｄｖａｌｉｄａｔｉｏｎ．Ｂｙ ｕｓｉｎｇｔｈｉｓｓｔｒａｔｅｇｙ， ７０ ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔｌｙ ｃｈａｎｇｅｄ ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｉｎ ｈｅｐａｔｏｃｅｌｌｕｌａｒ ｃａｒｃｉｎｏｍａ ｔｉｓｓｕｅｓ ｗｅｒｅ ｏｂｔａｉｎｅｄ， ａｍｏｎｇ ｗｈｉｃｈ ｓｅｖｅｎ ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｗｅｒｅ ｆｕｒｔｈｅｒ ｖａｌｉｄａｔｅｄ． Ｔｈｅ ｖａｌｉｄａｔｅｄ ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｃｏｎｔａｉｎ ｔｈｅ ｃｌｉｎｉｃａｌｌｙ ｕｓｅｄ ｈｅｐａｔｏｃｅｌｌｕｌａｒ ｃａｒｃｉｎｏｍａ （ＨＣＣ） ｂｉｏｍａｒｋｅｒ ａｌｐｈａ⁃ｆｅｔｏｐｒｏｔｅｉｎ （ＡＦＰ） ａｎｄ ｔｈｅ ｒｅｐｏｒｔｅｄ ｂｉｏｍ