2种虾虎鱼细胞色素b基因全序列克隆与分析.PDF

第 6 卷第 5 期 南 方 水 产 Vol. 6, No. 5 2 01 0 年 1 0月 South China Fisheries Science Oct. , 2010 doi: 10. 3969/j. issn. 1673 - 2227. 2010. 05. 007 2 种虾虎鱼细胞色素 b 基因全序列克隆与分析 陈 雷, 程远志, 王日昕, 徐田军 ( 浙江海洋学院海洋科学学院, 海洋生物资源与分子工程实验室, 浙江 舟山 316000) 摘要: 测定了矛尾刺虾虎鱼 ( Acanthogobius hasta) 和红狼牙虾虎鱼 ( Odontamblyopus rubicundus) 的线粒体细胞 色素 b ( Cyt b) 基因全序列。2 种虾虎鱼 Cyt b 基因序列全长均为 1 141 bp, 通过序列比对, 检测到 266 个变异位 点, 序列中碱基转换频率高于颠换, 碱基替换主要发生在密码子第 3 位。结合 GenBank 中的虾虎鱼科其他物种 的细胞色素 b 基因全序列, 利用 Kimura-双参数模型分析遗传距离表明, 10 种虾虎鱼科鱼类的遗传差异在 0. 118 ～0. 330 之间, 大头新虾虎鱼 ( Neogobius kessleri) 与同属的裸喉新虾虎鱼 ( N. gymnotrachelus) 遗传距离最小, 为 0. 118; 大头新虾虎鱼和矛尾刺虾虎鱼遗传距离最大, 为 0. 330 。以 Cyt b 基因全序列构建的 NJ 进化树分析表 明, 10 种虾虎鱼分为 3 个主要类群, 红狼牙虾虎鱼和矛尾刺虾虎鱼聚为 1 支, 且与其余 8 种虾虎鱼类遗传距离 较远。 关键词: 虾虎鱼科; 细胞色素 b; 序列分析; 系统发生 中图分类号: Q 532 + . 8 文献标志码: A 文章编号: 1673 - 2227 - ( 2010) 05 - 0043 - 07 Cloning and sequence analysis of Cyt b gene in 2 Gobiidae fishes CHEN Lei, CHENG Yuanzhi, WANG Rixin, XU Tianjun ( Lab. for Marine Living Resources and Molecular Engineering, College of Marine Science, Zhejiang Ocean University, Zhoushan 316000, China) Abstract: The complete sequences of Cyt b genes in Acanthogobius hasta and Odontamblyopus rubicundus were amplified, cloned and sequenced. The Cyt b genes in both species are 1 141 bp in length. Comparing the obtained sequences, we detect