4种大戟科植物Lhca基因家族的全基因组鉴定、分类与进化.PDF

第34 卷 第10 期 中 南 林 业 科 技 大 学 学 报 Vol. 34 No. 10 2014 年 10 月 Journal of Central South University of Forestry Technology Oct. 2014 4种大戟科植物Lhca 基因家族的全基因组鉴定、 分类与进化分析 邹 智，杨礼富，安 锋，林位夫 （中国热带农业科学院橡胶研究所/ 农业部儋州热带作物科学观测实验站，海南 儋州571737 ） 摘 要：LHCI 是植物光系统 I （PSI ）中与色素分子结合的一系列膜蛋白，由Lhca 基因家族编码，主要参与光 能的捕获与传递。虽然 Lhca 基因家族已在拟南芥、水稻、杨树等模式植物中得到了系统鉴定，但在以高光效和 高生物量著称的大戟科植物中，至今还未见 Lhca 类基因的报道。研究基于蓖麻、麻风树、木薯和橡胶树等 4 种 大戟科植物已公布的基因组和 EST 数据对 Lhca 基因家族进行全面鉴定，并分析了其基因结构、生化特性及进 Lhca Lhca Lhca 化关系。结果表明，蓖麻、麻风树、木薯和橡胶树分别含有 6、6、9 和 9 个 基因，分属于 1、 2 、 Lhca Lhca Lhca Lhca 3、 4 、 5 和 6 等 6 个亚家族，每个亚家族含有 1~2 个成员不等，基因的内含子数 目在 2~5 个之间， Lhca Lhca Lhca Lhca 部分基因还存在可变剪接形式。进化分析显示， 1 和 3 亚族具有较早的起源， 2 和 6 存在于陆 Lhca Lhca Lhca Lhca Lhca 生生物中， 4 和 5 则只存在于高等植物中；在木薯和橡胶树中， 1、 2 和 4 亚族都出现了 基因的扩增。 Lhca 关键词：大戟科植物；全基因组； 基因家族；鉴定；进化分析 中图分类号：S759.95 文献标志码：A 文章编号：1673-923X(2014) 10-0056-05 Genome-wide identification, classification and phylogenetic analysis of Lhca gene family in four Euphorbiaceae plants ZOU Zhi, YANG Li-fu, AN Feng, LIN Wei-Fu (Danzhou Investigation Experiment Station of Tropical Crops, Ministry of Agriculture/Rubber Research Instit