干旱胁迫下柑橘叶片基因表达谱的cdna-aflp分析-天恩泽.pdfVIP

园 艺 学 报 2011 ，38 （3 ）：417 –424 http: // www. ahs. ac. cn Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com 干旱胁迫下柑橘叶片基因表达谱的 cDNA-AFLP 分析 肖金平，陈俊伟，张慧琴，徐红霞，王慧亮，谢 鸣* （浙江省农业科学院园艺研究所，杭州 310021 ） 摘 要：为分离和鉴定柑橘干旱胁迫应答基因，应用 cDNA-AFLP 分析技术，以盆栽‘天草’橘橙枳 砧嫁接苗为试材，对正常灌水和不同干旱胁迫处理下叶片的基因表达谱进行分析。利用 81 对引物组合进 行扩增，共筛选获得 113 条差异表达转录衍生片段（TDF ），其中上调表达 71 条（63% ），下调表达 29 条 （26% ），其余 13 条（11%）为瞬时表达。选取 70 个差异表达 TDF 进行克隆测序，共得到 62 个有效序 列，BLAST 结果表明：33 个 TDF 与已知功能基因具较高同源性，功能涉及信号转导、能量代谢、离子 通道和蛋白合成等，18 个 TDF 与功能未知基因或假定基因同源性较高，其余 11 个 TDF 无同源序列，可 能为新的未知功能基因。 关键词：柑橘；干旱胁迫；基因表达谱；cDNA-AFLP 中图分类号：S 666 文献标识码：A 文章编号：0513-353X （2011 ）03-0417-08 Gene Expression Profiling in Response to Drought Stress in Citrus Leaves by cDNA-AFLP * XIAO Jin-ping ，CHEN Jun-wei，ZHANG Hui-qin ，XU Hong-xia ，WANG Hui-liang ，and XIE Ming （Horticulture Institute ，Zhejiang Academy of Agricultural and Sciences ，Hangzhou 310021 ，China） Abstract ：Transcripts involved in drought stress in ‘Amakusa ’tangor （Citrus reticulata × C. sinensis ） were identified by cDNA-AFLP gene expression profiling in leaves under normal watering and water deficit condition. A total of 113 differentially expressed transcript-derived fragments （TDFs ）were identified by selective PCR amplification using 81 primer combinations. The TDFs included 71 （63% ） upregulated ，29 （26% ）downregualted，and 13 （11%）transiently expressed genes. Seventy TDFs were recovered ，sequenced，and functionally annotated using sequence homology to GenBank entries. Out of the 70 TDFs，33 are homolog to genes with a known function，18 are similar to genes with unknown function， and 11 have not sequence homology to GenBank ent