薇菜ssr分子标记的开发及遗传多样性初步探讨-植物科学学报.pdfVIP

植物科学学报　 ２０１５ꎬ３３(６):８０１~８０７ Ｐｌａｎｔ ＳｃｉｅｎｃｅＪｏｕｒｎａｌ 　 　 ＤＯＩ:１０１１９１３/ ＰＳＪ２０９５￣０８３７２０１５６０８０１ 薇菜ＳＳＲ分子标记的开发及遗传多样性初步探讨 １ １ １ １ ２∗ １∗ 赵 杰 ꎬ 王玢琪 ꎬ 贾 晓 ꎬ 童益琴 ꎬ 何义发 ꎬ 葛台明 (１ 中国地质大学(武汉)湿地演化与生态恢复湖北省重点实验室ꎬ 武汉 ４３００７４ꎻ ２. 湖北民族学院林学园艺学院ꎬ 湖北恩施４４５０００) 摘　 要:利用改良ＦＩＡＳＣＯ法(Ｆａｓｔ ＩｓｏｌａｔｉｏｎｂｙＡＦＬＰＳｅｑｕｅｎｃｅｓＣＯｎｔａｉｎｉｎｇｒｅｐｅａｔｓ)开发出的９对多态性ＳＳＲ 引物评价了薇菜(ＯｓｍｕｎｄａｊａｐｏｎｉｃａＴｈｕｎｂ.)２个野生居群(庐山和恩施)、 １个栽培居群(恩施)的遗传多样性和 遗传分化水平ꎮ 结果显示ꎬ ９个ＳＳＲ标记在３个薇菜居群中共检测到４７个等位基因ꎬ 每个 ＳＳＲ位点的平均等 位基因数为５２２２个ꎬ 观测杂合度和期望杂合度分别为００００ ~０９４４和０５７７ ~０８３４ꎬ 香农指数为０９６２ ~ １８６０ꎬ 表明各ＳＳＲ位点多态性较高ꎻ 各居群的平均期望杂合度均大于平均观测杂合度且种内近交系数均为正 值ꎬ 说明３个薇菜居群中都存在非随机交配现象ꎻ 对各居群的相关遗传多样性参数分析表明ꎬ 恩施野生居群遗 传多样性最高ꎬ 而其栽培居群最低ꎻ 庐山野生居群与恩施野生居群间遗传分化系数为００９２ꎬ 说明两地野生薇菜 居群的遗传分化程度较低ꎬ ＡＭＯＶＡ分析也表明遗传变异主要存在于野生居群内部ꎮ 关键词:薇菜ꎻ 遗传多样性ꎻ ＳＳＲꎻ ＦＩＡＳＣＯ 中图分类号:Ｑ７５　 　 　 　 　 文献标识码:Ａ　 　 　 　 　 文章编号:２０９５￣０８３７(２０１５)０６￣０８０１￣０７ Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ｏｆ ＳＳＲ Ｍａｒｋｅｒｓ ｔｏ Ａｓｓｅｓｓ Ｇｅｎｅｔｉｃ Ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｉｎ ＯｓｍｕｎｄａｊａｐｏｎｉｃａＴｈｕｎｂ. １ １ １ １ ２∗ １∗ ＺＨＡＯＪｉｅ ꎬＷＡＮＧ Ｂｉｎ￣Ｑｉ ꎬＪＩＡ Ｘｉａｏ ꎬＴＯＮＧＹｉ￣Ｑｉｎ ꎬＨＥＹｉ￣Ｆａ ꎬＧＥＴａｉ￣Ｍｉｎｇ (１. Ｈｕｂｅｉ Ｋｅｙ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｏｆ Ｗｅｔｌａｎｄ Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ａｎｄ Ｅｃｏｌｏｇｉｃａｌ ＲｅｓｔｏｒａｔｉｏｎꎬＣｈｉｎａ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ ＧｅｏｓｃｉｅｎｃｅｓꎬＷｕｈａｎ ４３００７４ꎬＣｈｉｎａꎻ２. Ｓｃｈｏｏｌ ｏｆ Ｆｏｒｅｓｔｒｙ ａｎｄ ＨｏｒｔｉｃｕｌｔｕｒｅꎬＨｕｂｅｉ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｆｏｒ ＮａｔｉｏｎａｌｉｔｉｅｓꎬＥｎｓｈｉꎬＨｕｂｅｉ４４５０００ꎬＣｈｉｎａ) Ａｂｓｔｒａｃｔ: Ｎｉｎｅ ＳＳＲ ｍａｒｋｅｒｓ ｄｅｖｅｌｏｐｅｄ ｂｙ ａ ｍｏｄｉｆｉｅｄ ＦＩＡＳＣＯ (Ｆａｓｔ Ｉｓｏｌａｔｉｏｎ ｂｙ ＡＦＬＰ Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ＣＯｎｔａｉｎｉｎｇ ｒｅｐｅａｔｓ) ｍｅｔｈｏｄ ｗｅｒｅ ｕｓｅｄ ｔｏ ａｎａｌｙｚｅ ｔｈｅ ｇｅｎｅｔｉｃ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ａｎｄ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｔｉｏｎｏｆ ｔｈｒｅｅ Ｏｓｍｕｎｄａｊａｐｏｎｉｃａ Ｔｈｕｎｂ. ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓꎬ ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ ｔｗｏ ｗｉｌｄ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓ ｆｒｏｍ Ｌｕｓｈａｎ ａｎｄ Ｅｎｓｈｉ ａｎｄ ｏｎｅ ｃｕｌｔｕｒｅｄ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ ｆｒｏｍ Ｅｎｓｈｉ. Ａ ｔｏｔａｌ ｏｆ ４７ ａｌｌｅｌｅｓ ｗｅｒｅ ｄｅｔｅｃｔｅｄ ｉｎｔｈｅｔｈｒｅｅ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓꎬｗｉｔｈａ ｍｅａｎ Ｎ (ｎｕｍｂｅｒｏｆ ａｌｌｅｌｅｓ)ｏｆ５２２２.Ｔｈｅｏｂｓｅｒｖｅｄ