大青属植物通用性ssr引物筛选及应用.pdfVIP

中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第 45 卷 第 22 期 2014 年 11 月 ·3317 · 大青属植物通用性 SSR 引物筛选及应用 邓绍勇，温 强，李康琴，叶金山，朱培林* 江西省林业科学院，江西 南昌 330032 摘 要：目的 获得在大青属 Clerodendrum L. 主要树种间具有较好通用性的 SSR 标记，并构建 DNA 指纹图谱用于该属重 要民族药用植物近缘种的分子甄别和遗传学研究。方法 选用 2 种大青属植物伊豆大青 C. izuinsulare 和海州常山 C. trichotomum 的 19 对 SSR 引物，对大青属 9 个种共 9 个样本进行扩增检测。结果 17 对引物在广布种大青中有扩增产物， 通用率最高（89.5% ），另有 7 对引物在所有样本中有扩增产物，通用率为 36.8% 。采用多态性较好的 6 对 SSR 引物构建 9 个种的 DNA 指纹图谱，其中引物 CI140 可鉴定除白花灯笼和尖齿臭茉莉之外的 7 个种，该引物与 CI107、CI132、CI143 和 CT042 两两组合可鉴别所有 9 个种；利用遗传距离进行 UPGMA 聚类，结果显示腋序系白花灯笼单独成一组，海通和大青 成一组，其他聚类分组结果与其形态分类存在一定差别。结论 近缘种间共用 SSR 引物是开发大青属植物 SSR 标记行之有 效的方法，可为大青属植物分子标记资源的使用提供参考。 关键词：大青属；SSR；通用性；遗传距离；分子标记 中图分类号：R282.12 文献标志码：A 文章编号：0253 - 2670(2014)22 - 3317 - 06 DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2014.22.019 Screening and application of SSR primers in plants of Clerodendrum L. DENG Shao-yong, WEN Qiang, LI Kang-qin, YE Jin-shan, ZHU Pei-lin Forest Academy of Jiangxi Province, Nanchang 330032, China Abstract: Objective In order to obtain SSR primers which has good universality among the main tree species of Clerodendrum L., and then molecular screening of DNA fingerprints was used in closely related species and genetic research of these ethnical medicinal resources. Methods An experiment was conducted to study the transferability of 19 pairs of SSR primers developed from C. izuinsulare and C. trichotomum and amplified in nine samples from nine species of Clerodendrum L. Results Seventeen pairs of 19 primers had the amplification products in C. cyrtophyllum, a cosmopolitan species, the transferability ratio was the highest (89.5%). Seven pairs of primers were successfully amplified in all samples of Clerodendrum L. species, and the transferability ratio was 36.8%. Six pairs of polymorphism SSR primers were used to construct the DNA fingerprints of nine Cle