3人类基因组(修改).pptVIP

人类基因组计划(HGP) 美国政府决定于 1990年正式启动HGP，预计用 15 年时间，投入 30 亿美元，完成 HGP。 能源部和国立卫生研究院共同组成“人类基因组研究所” 逐渐地，HGP 扩展为多国协作计划。参与者包括：英、日、法、德和中国（1993年） 二000年六月二十六日克林顿宣布 人类基因组草图绘制完成 人类基因组草图基本信息 由31.65亿bp组成 含2~3万基因 与蛋白质合成有关 的基因占2% 展望 个人基因组测序的普及 30亿美元 1000万美元 100万美元 1万元人民币? ??? 未知物种基因组测序 3、序列图谱 是通过对基因组DNA进行碱基排列顺序分析而建立的图。 两种技术路线： 1.公共序列路线：即在物理图基础上，将各个BAC克隆片段切成更短的片段，形成亚克隆分别进行测序，再将相互重叠的读出序列组装成连续重叠线。 基因图测定方法：  1.CpG岛的应用：大多数持家基因和40%组织特异性基因5’端均存在CpG岛序列。制备探针，染色体涂染指示基因位置分布。 2.计算机识别：研发计算机GRAIL系统，可识别每个基因区的外显子-内含子接头区保守序列。 3.cDNA策略：由组织细胞中表达mRNA，逆转录合成cDNA片段，称为表达序列标签（EST），将收获EST定位后，构建的图称为转录图，是人类基因图雏形。 （二）比较基因组学 如要真正了解基因组在整体生命系统里的确切功能，还要进行模式生物的研究。因为要认识人类基因组，只看人类的DNA序列，或者只看蛋白质功能是不够的，人类基因中哪一些基因的结构决定了我们是人而不是黑猩猩，这就是比较生物学研究。 新一代测序开启了未来个性化治疗的大门。两年前，华盛顿大学研究白血病的Lukas Wartman博士被诊断出患上了他正在研究的疾病。病情迅速恶化，没有任何方法能治好他。随后，他的同事对他的癌症基因组进行了测序，发现了问题基因，更幸运的是，找到了对症的药物。如今，Wartman博士的病情正在好转。这个美好的故事不仅让科研人员欢欣鼓舞，也为更多正面临痛苦的患者带来希望。 2.定位克隆 ⑴收集目的遗传病的家系，选择遗传标记进行连锁分析，建立目的遗传病与基因组中某染色体区域中遗传标记的连锁关系。 ⑵根据这一位置信息，将遗传图中初步确定的位置，转变成物理图中相应区域的DNA“邻接克隆群”。 ⑶从相应区域的“邻接克隆群”中筛选可表达的结构基因，作为候选基因； ⑷在若干个候选基因中进行转录表达和突变鉴定分析，最终将目的遗传病的决定基因精确定位和分离克隆该基因。 定位克隆(positional cloning)策略示意 DNA测序 遗传家系 遗传图谱 连锁定位分析 物理图谱 候选克隆 表达图谱 候选基因 Met Val Ser Leu Gln Pro A T G G T C T C A C T G C A A C C G A T G G T C T C A C T G T A A C C G Met Val Ser Leu Stop 突变检测 功能克隆与定位克隆的比较 3.候选克隆 候选克隆策略是在已定位和已克隆的基因越来越多的背景下，形成的一种新的基因克隆途径。 分为： 定位候选克隆 功能候选克隆 ? 从系列候选基因克隆中，鉴定某遗传病决定基因克隆的方法：  ⑴特异突变筛选法 ⑵在体外恢复正常表型法 ⑶构建小鼠疾病模型法??? ? 三、全基因组扫描 （一）全基因组扫描策略 全基因组扫描的策略是利用特定的引物将某条染色体上特定位置的微卫星DNA扩增出来，电泳检测后用统计软件进行遗传统计分析，寻找与疾病相关的易感基因。 （二）全基因组扫描方法 全基因组扫描所利用的是在人类基因组大量存在的多态性标记微卫星DNA或SNP，全基因组扫描时每个个体的 DNA经酶切、PCR扩增、 荧光标记、 电泳检测后即可得到每个个体大量微卫星DNA或SNP的具体信息, 用统计软件经遗传分析，得到定位结果。 目前已可用全基因组扫描的SNP芯片，操作更为简单，且定位的区域一般比微卫星定位的小很多。 第四节 基因组医学 ? 基因组医学（Genomic Medicine）就是将生命科学和临床医学结合，将人类基因组成果转化应用到临床实践中去的科学。基因组医学是以人类基因组为基础的生命科学和临床医学的革命，它将对整个21世纪产生重大社会影响和重大经济效益。 人类基因组医学将会推动临床医学研究，将从结构基因组，功能