双孢蘑菇分解基质能力退化的ddrt-pcr分析.pdfVIP

Mycosystema 菌 物 学 报 15 September 2010, 29(5): 707-712 jwxt@ ISSN1672-6472 CN11-5180Q ©2010 Institute of Microbiology, CAS, all rights reserved. 双孢蘑菇分解基质能力退化的 DDRT-PCR 分析 1,2 1 1 1 2* 陈美元 王泽生 李洪荣 廖剑华 谢宝贵 1 福建省农业科学院食用菌研究所 福州 350014 2 福建农林大学菌物研究中心 福州 350002 摘 要：对 4 种不同液体培养基培养的双孢蘑菇Agaricus bisporus CGMCC No. 0214 及其分解基质能力退化菌株 0214-3、 0214-5 进行了 24 对引物组合的 mRNA 差异显示（DDRT-PCR ）分析，结果发现8 对引物组合扩增出可重复的差异，并克隆 了 9 条差异片段。序列分析结果显示 9 条差异片段代表了 5 个基因的差异，它们与不同生物的 ATP 结合盒式运输亚家族 A 某蛋白、碳水化合物酯酶家族 4 蛋白、几丁质脱乙酰基酶、乙酰木聚糖酯酶 II 及其他一些未知蛋白具有较高的同源性。本 研究结果为进一步进行双孢蘑菇分解基质能力退化的分子机理研究奠定了良好的基础。 关键词：食用菌，mRNA ，差异DNA 片段，克隆，多糖类基质 DDRT-PCR analysis of the substrate-decomposing capability of degenerate strains of Agaricus bisporus CHEN Mei-Yuan1, 2 WANG Ze-Sheng1 LI Hong-Rong1 LIAO Jian-Hua1 XIE Bao-Gui2* 1Institute of Edible Fungi, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou 350014, China 2Mycological Research Center of Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002, China Abstract: mRNA differential display reverse transcription-PCR (DDRT-PCR) analysis with 24 pairs of primers was used to analyze mRNA differences between the wild type of Agaricus bisporus strain CGMCC No. 0214 and its substrate-decomposing ability degeneration strains 0214-3 and 0214-5 cultured in 4 kinds of different liquid media. As a result, 8 pairs of primers showed repeatable differences, and 9 special fragments were cloned. Sequencing analysis showed that 9 special fragments represented 5 different genes. These genes have high homologies with an ATP-binding cassette transporter subfamily A protein, carbohydrate esterase fam