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第04章蛋白质化学
第五节 蛋白质的性质 Characters of Protein 一、蛋白质分子的大小、形状及分子量测定 1、分子筛层析 2、SDSSDS-十二烷基硫酸钠 3、生物质谱 二、蛋白质的变性 * 蛋白质的变性(denaturation) 在某些物理和化学因素作用下,其特定的空间构象发生改变或破坏,从而导致其理化性质改变和生物活性的丧失。 1、变性的本质 —— 破坏非共价键和二硫键,不改变蛋白质的一级结构。 生物活性的丧失 理化性质的改变 如:黏度增加,失去结晶能力,易被蛋白酶水解等 2、变性蛋白的特征 3、变性作用的因素和程度 如加热、紫外线、乙醇等有机溶剂、强酸、强碱、重金属离子及生物碱试剂等 。 4、变性作用的意义 酒精、紫外线消毒; 高温灭; 除去杂蛋白; 避免活性成分变性。 1、氨基酸的两性解离及等电点 氨基酸是两性电解质,其解离程度取决于所处溶液的酸碱度。 氨基酸等电点(isoelectric point, pI) 在某一pH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性。此时溶液的pH值称为该氨基酸的等电点。 三、蛋白质的两性电离与等电点 pH=pI +OH- pHpI +H+ +OH- +H+ pHpI 氨基酸的兼性离子 阳离子 阴离子 (二)蛋白质的二级结构 蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构,即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置,并不涉及氨基酸残基侧链的构象。 定义 主要的化学键: 氢键 蛋白质二级结构的主要形式 ?-螺旋 ( ? -helix ) ?-折叠 ( ?-pleated sheet ) ?-转角 ( ?-turn ) 无规线团 ( random coil ) 肽键具有部分双键的性质,不能自由旋转。参与肽键的6个原子C?1、C、O、N、H、C?2位于同一平面,称为肽键平面,也称肽单元 (peptide unit) 。 1.肽单位 2. ?-螺旋 结构特点: 右手螺旋 每螺旋圈包含3.6个氨基酸残基,每个残基跨 距0.15nm,螺旋上升一圈0.54nm。 相邻螺旋之间通过肽键上的酰基氧与亚氨基氢 间形成氢键保持螺旋结构稳定。氢键方向与螺 旋长轴基本平行。 氨基酸侧链伸向螺旋外侧,对?-螺旋的形成有一定影响。 二级结构中的氢键 3.?-折叠 要点: ⑴ 肽键平面折叠成锯齿状(折纸状)R-基团交错位于齿状结构上下方 ⑵氢键维持稳定与主链长轴垂直 ⑶两条以上肽链并列时, ?-片层有顺式和反式平行(4)R-基团太大时, ?-折叠不易形成 β-折叠:顺式和反式中的氢键 4. ?-转角 ?-转角 无规卷曲是用来阐述没有确定规律性的那部分肽链结构。 5.无规卷曲 RNase的分子结构 (三)超二级结构模体(motif) 多肽链顺序上相邻的二级结构常常在空间折叠中靠近,彼此相互作用,形成有规则的二级结构聚集体(motif)。这种规则的二级结构的聚集体称为超二级结构,它们可直接作为三级结构的“建筑块”或结构域的组成单位,是蛋白质发挥特定功能的基础。 钙结合蛋白中结合钙离子的模体 锌指结构 纤连蛋白分子的结构域 (四)结构域(domain) 在较大的蛋白质分子中,由多肽链上相邻的超二级结构紧密的联系,进一步折叠形成一个或多个相对独立的三维实体,各行使其功能,称为结构域(domain) 。 特点: 结构域与分子整体以共价键相连 具有相对独立的空间构象和生物学功能 同一蛋白质中的结构域可以相同或不同,不同蛋白质中的结构域也可能相同或不同 疏水键、离子键、氢键和 Van der Waals力等。 主要的化学键:次级键 整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置。即肽链中所有原子在三维空间的排布位置。 (五)蛋白质的三级结构 具有三级结构的蛋白质才具有生物学活性,三级结构一旦破坏,蛋白质的生物学功能丧失 胰岛素分子的三级结构 溶菌酶的三级结构 (六)蛋白质的四级结构 血红蛋白的四级结构 蛋白质结构示意图 三、蛋白质和多肽合成的基本原理 (二)采用生物技术合成蛋白质 (一)化学合成法的基本原理 1. 氨基酸的基团保护 2. 多肽的液相合成 3. 多肽的固相合成 1. 基因工程 2. 细胞工程 3. 酶工程 蛋白质结构与功能 Structure and Function of Protein 第 四 节 一级结构是蛋白质生物学功能的基础 一、蛋白质一级结构与功能的关系 1、一级结构不同,功能不同 (一)一级结构与功能的关系 剩2-10% 丧失活性 活性仍100% 2. 一级结构中“关键”部位相同,其功能也相同
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