鸡MHC-B区域内复合微卫星LEI0258位点等位基因的序列变异.pdfVIP

鸡MHC-B区域内复合微卫星LEI0258位点等位基因的序列变异.pdf

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2010年 8月 甘 肃 农 业 大 学 学 报 第 45卷 第 4期 16~21 JOURNAL OFGANSU AGRICULTURALUNIVERSITY 双 月 刊 鸡 MHC—B区域内复合微卫星 LE10258位点 等位基因的序列变异 万君兴 。,罗玉柱 ,韩建林 (1.甘肃农业大学动物科学技术学院,甘肃 兰州 730070;2.中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 ,农业部畜禽遗传 资源与利用重点开放实验室,北京 100193;3.中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 ,国际家畜研究所 , 畜禽牧草遗传资源联合实验室,北京 100193) 摘要 :在对 15个样品鸡 MHC—B区域 内复合微卫星位点LE10258的等位基 因进行基 因型分析 的基础上 ,进~ 步开展 了等位基 因PCR产物的直接测序或克隆测序,并将获得的序列与 GenBank中的 18条同源序列作 了比较. 结果表 明:LE10258位点等位基 因片段大小分别为 247bp、249bp、307bp、357bp、369bp、381bp、393bp或 443bp 的等位基因具有不同的DNA序列或结构 ;上、下游共有 3个 in/dels和 7个 SNPs;由 12bp和 13bp组成 的重复单 元 中也存 在一 定 的变异 ,其 中,H 23中一 个 13bp的重 复 单元 由标 准 的 “CTATGTCTTCTTT”变 为 “CTATATcTTcTTT”,HRJ5和 JT01中各有一个 12bp的重复单元 由标准 的 “CTTTCCTTCTTT”变为 “CTTC— CCTTCTTT”,而HRJ5、HRJ15和 P22中也各有一个 12bp的重复单元 由标 准的 “CTTTcCTTCTTT”变为 “CTTTTCTTCTTT”. 关键词 :鸡 ;MHc;微卫星 ;LE10258;序列 中图分类号 :S831.2 文献标识码 :A 文章编号 :1003—4315(2010)04—0016—06 一 ● ● ● 1 1 1 1 1 ● ● ● - eauencevarlatlOnsin allelesatthe com poundm lcrOsatellite locusLE10258withinchickenM HC—B region WAN Jun—xing .LUO Yu—zhu .HAN Jian—lin,。 (1.CollegeofAnimalScienceandTechnology,GansuAgriculturalUniversity,Lanzhou730070,China;2 . KeyLaboratory ofFarm AnimalGeneticResourcesandUtilizationofMinistryofAgriculture,InstituteofAnimalSciences,Chinese AcademyofAgriculturalSciences(CAAS),Beijing100193,China;3.CAAS-ILRIJointLaboratory onLivestockandForageGeneticResources,InstituteofAnimalSciences,Chinese AcademyofAgricult

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