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噬菌斑电子图像的计算机处理及其自动计数
维普资讯
第 18卷 4期 中 国 病 毒 学 18 (4):387— 390
2003年 8月 VIR0L0GICA SINIGA August 2003
噬菌斑 电子图像 的计算机处理及其 自动计数
张俊祥 1,肖 茜2,方呈祥 h,范成鹏 ,朱石桥 ,张珞珍
(1.武汉大学生命科学学院,湖北武汉,430072;2.华中科技大学计算机科学与技术学 院,湖北武汉 。430074)
PlaqueElectronicImageSegmentandAutomaticCountingbyComputer
ZHANGJun—xiang,XIAOQian,FANGCheng—xiang ,FANCheng—peng。,
ZHU Shi—qiao ,ZHANG Luo—zhen
(1.CollegeofLifeSciences,WuhanUniversity,Wuhan430072,China;2.DepartmentofComputerandTechnology
HuazhongUniversiytScienceandTechnology,Wuhan430074,ChinaJ
Abstrat:Plaquescounting isa routine method in thehteoryresearch and practicedapplication of
microbiology.Becauseofweak contrastbetween plaquenad htebackground ofhteplate,nad hte
plaqueslinkingtogether,aseriouserrorwasproducedusingautomaticcountingbycomputer.Sohtat
plaqueshavebeencountedbyartificialmethod.Inthepresentstudy,anew mehtodwasestablishedfor
automaticcountingplaquesbycomputer.Atfirst,Theplaqueswereformedby infectingEscherichia
coliwith 入 bacteriophage,andprepraedashtemethodofsoft—agra layerplate.Th eelectricalimages
countedhteplaqueswereobtainedby screeninghteplaquesplates.A representativeraea,inwhichhte
plaqueswerelinkedeachohter,waspickedoutfrom eachimage,nadhna dedwiht watershedalgorithm.
Th eplaqueslinkingtogehterweresepraatedintoindividualplaquealoneinhteimages.Andhten,hte
imageswerecountedwiht htemethodofgrowht algorithm basedonraeabycomputer.Th eexacteffect
ofcountingplaqueswasinagreementwiht artificialmethod .Itindicateshtenew mehtodofcounting
plaquescna beusedinautomaticcountingbycomputer.
Keywords:Hna dleimage;Watershedalgorihtm;Automaticcounting;Growthalgorithm basedonraea.
摘要:噬菌斑平板计数是微生物学理论研究与实际应用 中常用的方法之一。
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