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举例：phyA 　每一个文件都可以有数种阅读方式，目的各不相同。一般来说，“引文格式(citation)”最适合于阅读Medline形式的文件；“GenPept” 格式适用于阅读蛋白质文件;“GenBank”格式用来阅读核酸文件。 Entrez系统 阅读文献(Viewing Document) 　 对于PubMed文章： 　　引文(citation)格式：包含题目，文摘,MeSH主题词等 　　文摘格式：包含题目，文摘 　　ASN.1格式：文章以ASN.1格式出现 　　MEDLINE格式：文章以MEDLINE格式出现 对于蛋白和核酸文件： 　　GenBank/GenPept格式: 标准的GenBank或GenPept格式 　　Report格式：GenBank格式 　　ASN.1格式 　　FASTA格式 　　图形格式(Graphic View) 对于结构文件： 　　结构总结格式：结构的基本信息，可以看三维结构 　　ASN.1格式： 对于基因组文件： 　　图形格式 　　ASN.1格式 Entrez系统 阅读方式：可单一阅读，亦可成批阅读 Entrez系统的使用方法 进入NCBI主页(www.ncbi.nlm.nih)，即可看到位于页面上部的数据库检索栏，其缺省检索选项为核酸序列数据库GenBank(图5)。可以在检索栏中直接输入需要查询的内容。例如，需要检索蜘蛛毒素的核苷酸序列，在检索栏中输入“spider toxin”，点击起始按钮“Go”，则可得到核酸序列数据库GenBank中和蜘蛛毒素相关的序列条目，一共17条。 图5 进入NCBI主页 　GenBank和EMBL等核酸序列数据库中的大部分数据，是由生物学家通过计算机网络直接提交，或通过计算机程序直接从大规模序列测定所得结果送入数据库中，没有严格的标准。 在数据库查询时，经常会遇到“想找的找不到，找到的却不是”这样的问题。例如，上述“spider toxin”查询所得到的17个序列条目，有很大一部分是重复的；而我国特有蜘蛛“虎纹捕鸟蛛”的毒素(Huwentoxin)却没有检索到。这是因为作者在提交该序列时，使用了“Huwentoxin”，而没有使用“spider toxin”。因此，必须输入“Huwentoxin”，才能找到该序列条目(图6)。 GenBank核酸序列数据库中虎纹捕鸟蛛毒素Huwentoxin-I条目 　　尽管Entez系统使用方便，初次使用时，最好阅读一下联机帮助文件，按其提供的向导实例练习一遍，以便提高查询效率，很快找到需要的结果。点击中页面左侧的“About Enterz”按钮，即可进入其帮助页面(图6)。该页面的下方有一个说明各数据库之间相互关系的框图，点击图中的数据库名，即可进入该数据库的帮助页面。而点击右上方“More about”下的“Entrez”，则进入Entrez使用详解。点击“Try a tutorial”，则开始联机向导练习。该向导以查询结核杆菌基因组中编码青霉素结合蛋白(penicillin-binding)基因为例，边操作、边讲解，直到找到需要的结果 图6 Entrez数据库查询系统帮助页面 　　通过向导练习，可以熟悉Entrez系统的各种辅助功能，包括限定查询范围(Limits)、预览查询结果(Preview/Index)、查看查询记载(History)和操作剪贴板(Clipboard)，提高查询效率。点击Limits按钮，即可进入限定查询范围页面，可以根据该数据库结构，将输入的关键词的查询范围限制在某个范围内，如编号、代码、提交日期等。 　 　不同的数据库，其限定范围不同，如序列数据库可以限定序列长度，文献数据库则可以限定作者、题目、杂志名称等。 点击预览查询按钮(Preview/Index)，检索栏中会增加一个“Preview”按钮，输入关键词后，若点击“Preview”按钮，则不列出具体查询结果，而只列出查询到的数据条目数。利用这一辅助功能，可以提高查询速度，并对查询结果有个初步了解，以便对查询结果作进一步处理，缩小查询范围。 点击“History”按钮，则可以查看查询过程的记录，对每次查询结果进行分析，并作进一步处理。 例如，若需要检索与细胞凋亡有关的自噬基因“autophagy”的核酸序列，可以按下面步骤进行： （1） 进入NCBI主页，点击Entrez按钮进入Entrez查询系统，点击“Nucleotide”按钮选择核酸序列数据库； （2） 点击“Limits”按钮，在检索栏中填入“Autophagy”并在“Limited to”选择栏中选择“Title word”；点击“Preview/Index”按钮进入Preview页面，点击检索栏内的“Preview”按钮，得到核酸序列数据