应用功能基因组学方法鉴定复方苦参注射液抗癌分子机制.docxVIP

Oncotarget摘要：复方苦参注射液（CKI）被用来治疗各类实体瘤已有15年之久，但是，传统中药是植物次生代谢物的复杂混合物，因此，探究其分子机制非常重要。作者采用乳腺癌细胞系MCF-7作为研究模型来研究CKI对基因表达的影响。不2种浓度的CKI处理细胞 24h和48h，用XTT和Annexin V/PI染色分别检测细胞增殖和凋亡。CKI或5-氟尿嘧啶（5-FU）分别处理细胞24h和48h后用高通量测序技术检测其转录组数据。结果提示CKI通过剂量效应抑制MCF-7细胞增殖，诱导凋亡。作者采用的转录组分析方法包括基因差异表达分析、信号通路分析、新lncRNA分析、共表达网络分析等。CKI对MCF-7细胞的调控在多条与细胞周期相关。CKI 可能通过p53诱导MCF-7细胞的凋亡。此外，很多新发现的lncRNA的表达可能受CKI的影响。研究思路：研究两点：中药的是我国传统医学的重要组成，但具体机制未知；高通量测序技术为医药研究提供了新思路。结果分析：CKI抑制MCF-7细胞的增殖，诱导细胞的凋亡CKI和5-FU对MCF细胞增殖的抑制具有剂量依赖性，浓度越高，效果越显著。对细胞凋亡的诱导同样具有剂量效应，浓度越高，细胞凋亡越明显。CKI对MCF-7细胞表达谱的影响分别采用不同浓度的CKI和5-FU处理后，进行RNA-seq测序。CKI与5-FU处理组表达谱明显不同。低剂量处理差异基因较