zhangzyd@ustc.edu.cn中国科技大学超级运算中心.PDFVIP

MaterialsStudio 的安装与并行计算使用手册 zhangzyd@ustc.edu.cn 中国科技大学 超级运算中心 2012-07-26 一、 安装前说明: 1. 中国科技大学超级运算中心（以下简称超算中心）服务器的操 作系统多为CentOS x86_64 Linux 系统，无任何版本的Windows 系统环境提供计算。计算用户在安装MaterialsStudio 软件时请 选择使用相应的linux 版本软件以及对应的软件许可。 MaterialsStudio 软件不支持AIX 系统，因此不可在超算中心的 IBM-JS22 刀片服务器上安装使用。 2. 计算用户在超算中心服务器系统上安装使用MaterialsStudio 软 件之前，应对计算软件本身以及Linux 系统的基本命令、LSF 作 业管理系统的使用有所学习了解。 3. 超算中心禁止用户以客户端/ 服务器端的模式使用 MaterialsStudio 计算软件，本手册主要介绍 MaterialsStudio 软 件在 CentOS 系统的命令行模式下的安装、配置以及协同 LSF 作业管理系统的命令行提交方法。 二、 测试环境介绍： 以超算中心刀片及胖节点服务器系统上，个人计算用户zhangzyd 安装软件为例说明，其他计算用户在超算中心其他服务器系统上安装 MaterialsStudio 软件时可参考执行。 操作系统： CentOS release 6.2 x86_64 GNU/Linux 编译器： Intel v12.1.3 、PGI v10.6、GCC v4.4.6 等C/C++、Fortran 编译器 数值函数库： Intel MKL 等 并行环境： Open MPI，支持MPI 并行程序 作业管理系统： Platform LSF 系统用户使用指南： 刀片及胖节点服务器用户使用指南 测试安装软件： MaterialsStudio6.0 三、 软件安装： 1. 在个人计算账号下建立soft 文件夹作为软件安装文件的存放目录， 并将软件安装包MaterialsStudio60.tar 以及软件许可msi.lic 上传至 soft 文件夹下。 [zhangzyd@sugon ~]$ mkdir soft 上传文件后： [zhangzyd@sugon ~]$ cd soft [zhangzyd@sugon soft]$ ls MaterialsStudio60.tar msi.lic 2. 解压缩文件MaterialsStudio60.tar 得到MaterialsStudio60 文件目录， 进入MaterialsStudio60 文件目录开始安装。 [zhangzyd@sugon soft]$ tar -xvf MaterialsStudio60.tar [zhangzyd@sugon soft]$ ls MaterialsStudio60 MaterialsStudio60.tar msi.lic [zhangzyd@sugon soft]$ cd MaterialsStudio60 [zhangzyd@sugon MaterialsStudio60]$ ls Info install lib LicensePack msi.lic README_Materials_Studio.htm rpms 执行安装命令./install 并导入软件许可。软件只能以非root 身份 用户安装，安装过程中均默认即可，会在个人账号根目录下生成 Accelrys 目录。执行命令： [zhangzyd@sugon MaterialsStudio60]$ ./install 。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。(均默认安装即可) [zhangzyd@sugon ~]$ cd [zhangzyd@sugon ~]$ ls Accel