基于RNA-seq数据大规模开发中华蜜蜂幼虫的SSR分子标记.PDFVIP

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2017-11-27 发布于天津
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基于RNA-seq数据大规模开发中华蜜蜂幼虫的SSR分子标记.PDF

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基于RNA-seq数据大规模开发中华蜜蜂幼虫的SSR分子标记.PDF

2017 ，39 (1):68 － 74 http : hjkcxb. alljournals. net 环境昆虫学报 ∥ Journal of Environmental Entomology doi :10. 3969 /j. issn. 1674 － 0858. 2017. 01. 7 ，，，． RNA-seq SSR ［J］．，20 17 ，39 (1):68 － 74 ．熊翠玲张璐付中民等基于数据大规模开发中华蜜蜂幼虫的分子标记环境昆虫学报基于RNA-seq 数据大规模开发中华蜜蜂幼虫的 SSR 分子标记 * * ，，，，，，，熊翠玲张璐付中民王鸿权侯志贤童新宇李汶东＊＊＊＊，，郑燕珍陈大福郭睿 ( ， 350002) 福建农林大学蜂学学院福州 : ，。摘要中华蜜蜂是东方蜜蜂的一个亚种也是我国的特有蜂种本研究基于已获得的中华蜜蜂幼虫肠道转录组 SSR ， SSR SSR 。 MISA 数据预测分子标记并进行位点的信息分析和引物的发掘利用软件对幼虫肠道转录组中 43557 unigenes ， 13448 SSR ， 7763 unigene ，数据组装得到的条进行搜索共预测出个位点它们分布于条中其中最主要的重复类型为二核苷酸重复 (58. 03% )， (28. 23% ) (9. 72% )。其次为三核苷酸重复和四核苷酸重复 AT / AT ( 30. 4 % )。 SSR ， Primer Premier 5 二核苷酸重复中的基序主要是占总量的对于所有的位点利用软件成 21627 ， 48 5