出国报告出国类别进修-台中荣民总医院.docVIP

出國報告（出國類別：進修） 以全基因組關聯研究(Genome-wide Association Study, GWAS)及後續相關基因定序研究糖尿病併發症及心血管疾病的基因 服務機關：台中榮民總醫院 姓名職稱：李奕德主治醫師 派赴國家：美國 出國期間：98年10月26日至99年10月3日 報告日期：99年10月31日 摘要 就臨床而言，糖尿病或心血管疾病的罹病風險與家族史關係密切。因此，這類common disease的遺傳研究對病人風險的評估及治療目標的定位非常重要。但由於非單一致病基因，傳統遺傳探討模式無法掌握到大部分的基因。近年來人類基因圖譜的發展加上科技發展，使得不需事前假設基因位置的全基因掃描變為可行。但因為需要龐大的經費與檢體，使這類研究無法由單一機構獨自完成。個人藉由這次合作與進修機會，到目前進行此類研究的主導機構學習。期望提供後續合作與我們朝此方向發展的機會。 目次 摘要 …………………………………………………………………… 1 目次 …………………………………………………………………… 2 本文 前言 ……………………………………………………………… 3 目的 ……………………………………………………………… 3 過程 ……………………………………………………………… 4 心得 ……………………………………………………………… 6 建議 ……………………………………………………………… 6 前言： 個人參與糖尿病研究約十年，主要著重於臨床領域。近六年攻讀研究所，接觸到不少基礎的研究。但因臨床工作之故，難以全力投入實驗室工作。個人陸續取得碩士與博士學位後，終於得以申請到出國進修的機會。進修的目的除了能全職參與實驗室工作，主要仍是藉此機會能參與國外大型合作計劃。不但可見到最新的研究方法與技術，也增加將來合作機會。糖尿病或心血管疾病與家族史有密切關係，然而過去在遺傳研究方面難有大突破。近年來因為人類基因圖譜的發展，使全基因掃描變為可能。也形成使用全基因組關聯研究(Genome-wide Association Study, GWAS) 去尋找複雜遺傳疾病的可能相關基因的風潮。因為過去美國加州洛杉磯的西奈山醫院 (Cedars-Sinai Medical Center, Los Angeles, California, USA) 利用GWA在Inflammatory Bowel Diseases有卓越的發現；近年來也針對糖尿病併發症及心血管疾病積極投入。於是個人選擇其醫學基因部門 (Medical Genetics Institute)為進修地點。 目的 這次進修的主要目的為探討糖尿病併發症及心血管疾病的可能基因。因糖尿病併發症或心血管疾病受基因的因素影響極大。然而這類common diseases也非單基因遺傳，可能是許多基因共同影響所致。人類彼此間的基因其實差距可能只有1%，但這小部分的基因差距可能就是決定某些人容易罹病的關鍵。但利用傳統genotyping無法從浩大的染色體中找到這些基因。藉由2003年 the Human Genome Project及2005年 the International HapMap Project完成的整個基因圖譜，我們有機會去瞭解那些基因對應甚麼疾病，或分析那些基因變異造成甚麼疾病發生。利用電腦軟體程式分析資料，GWA研究能全基因掃瞄並快速地篩選及分析出那些基因的變異造成疾病。簡單地就心血管疾病而言，為執行GWA研究，需要有心血管疾病患者的DNA及無心血管疾病患者的DNA。藉由生化與臨床的資料連結與校正，我們可以分析心血管疾病的相關基因。 過程 Cedars-Sinai Medical Center是一個有歷史傳統的醫院。早在100年前創立時，是只有12床的服務性醫療機構。經過幾番遷移與擴大，目前已是超過900床的醫學中心，約有2000位醫師與約10000位員工服務於此。藉著臨床醫師與基礎研究者的合作，Cedars-Sinai Medical Center在許多領域的研究相當著名，尤其在基因研究方面佔有很重要的地位。 為了在Cedars-Sinai Medical Center參與實驗室工作，必須先進行嚴格的訓練。包含：瞭解實驗室規則，安全規範與正確的操作過程。經過訓練後還必須接受每項考核，約兩週後確認通過後，才能在親自進行實驗工作。剛開始的三個月，我先後輪調三個實驗室，跟著各實驗室的leader進行工作。這段時間主要是操作 RNA amplification或生化檢測，以期熟悉及適應環境。 真正參與GWA研究前，必須先抽取血中DNA。雖然有自動化機器可製備DNA標本，但因GWA晶片昂貴，要求DNA品質必須高標準且一致，以減少失敗率。但因為這次的檢體