基于异源cdna基因芯片杂交的鳜鱼肌肉组织基因表达-水生生物学报.pdfVIP

第 33卷 第 1期 水 生 生 物 学 报 Vo l3 3 , No 1 2 0 0 9 年 1 月 ACTA HYDROB IOLO GICA SIN ICA J an, 2 0 0　9 DO I号 : 103724 / SPJ 0000200910046 基于异源 cD NA 基因芯片杂交的鳜鱼肌肉组织基因表达谱初步分析 1 2 1 3 1 1 张建社 　夏新界 　褚武英 　陈定根 　符贵红 　刘 　臻 1 1 1 成 　嘉 　刘 　芳 　鲁双庆 ( 1长沙大学生物工程与环境科学系 ,长沙 　4 10003; 2 中国科学院长沙亚热带农业生态研究所 ,长沙 　4 10125; 3D ep artm ent of M ath and Statistic s, South D akota State Un iversity, B rook ings, SD 　57006 , U SA ) 摘要 : cDNA 基因芯片技术已广泛应用于生物物种间功能基因组和表达谱学研究 。然而 ,鱼类基因芯片开发和应用 相对落后 。为了筛选与肉质性状相关功能基因 ,本研究首次试用异源斑马鱼基因 cDNA 芯片 ,对两种肉质性状明 显差异的鳜鱼和鲢鱼肌肉组织中基因表达进行了比较分析 。从两种鱼肌肉组织中提取总 RNA ,经 B iotin 荧光标记 ( ) 与拥有 156 17个 cDNA 片段的斑马鱼基因芯片 A ffym etrix 杂交后 ,检测出 375 个表达基因。与鲢鱼比较 ,鳜鱼肌 肉组织锁定的基因中有 180个上调表达基因和 195个下调表达基因。在鳜鱼肌肉组织 180个上调基因中 , 49个为 已知功能基因 , 131个为未知功能基因。根据基因文库同源功能基因分析 ,我们将 49个已知上调基因按功能大约 ( ) 分为七大类 ,其中与肌肉结构相关基因包括肌球蛋白重链基因 M YH 、肌纤维间连接基因和细胞骨架结构基因等 。 同时 ,我们对与肉质结构性状密切相关的功能基因进行了分析 ,并结合与鳜鱼优 良肉质结构和功能基因表达关系 进行了讨论 。 关键词 :鳜鱼 ;鲢鱼 ;肌肉组织 ;基因表达 ;基因芯片 中图分类号 : Q785　　文献标识码 : A 　　文章编号 :(2009) 0 1004608 基因芯片技术是 目前最快捷和有效的分子生物 此外 , cDNA 基因芯片技术还被成功地应用于鱼类 学方法之一 ,可用来从全基因组水平上研究控制某 免疫基因的锁定 [ 5—7 ] 、病原微生物基因控制 [ 8—10 ] 以 一生物个体或同一个体不同发育阶段 ,或不同组织 及环境毒性因子影响的基因表达 [ 11, 12 ] 等 。 ( ) 的基因或基因表达水平 。它的基本原理是将高达一 鳜鱼 M andarine fish 又称桂花鱼 ,