生命编码秘密探究概述.ppt

生命编码基本知识 限制图谱 多重图谱 求解DDP的算法 克隆与克隆文库 基因组图谱 序列装配 生命编码基本知识 数据库与快速装配 动态规划、两个序列比对 多重序列比对 RNA二级结构、三级结构 树和序列 思考题和作业 1、什么是计算生物学？ 2、DNA和RNA的四种碱基各是什么？ 3、你是如何理解计算生物学的？ DNA是遗传物质的基础 1、DNA-脱氧核糖核酸：核苷酸 的小分子生成的聚合物 （核苷酸是核酸最小的活性分子 ） 2、核苷酸有四种（DNA）： 腺嘌呤脱氧核糖核苷酸(A)、胞嘧啶核苷酸（C）、鸟嘌呤核苷酸（G）、 胸腺嘧啶核苷酸（T） A、C、G、U、T碱基生化图 DNA是遗传物质的基础 DNA分子两条链之间的距离是一定的，为2nm 嘌呤和嘧啶的分子结构不同，嘌呤是双环化合物，嘧啶是单环化合物 DNA是遗传物质的基础 若两条链上对应的碱基都是嘌呤环，则所占的空间太大；若两条链上相对应的碱基都是嘧啶环，则相聚距离太远，不能形成氢键。 只能是一个嘌呤与一个嘧啶配成碱基对，其长才为2nm RNA-核糖核酸 RNA-核糖核酸 腺嘌呤(A)、胞嘧啶（C）、鸟嘌呤（G）、 尿嘧啶（U） RNA存在时间很短，一般小于30分钟，有的仅存在几秒钟 嘌呤和嘧啶 嘌呤是双环、嘧啶是单环 嘌呤只能与嘧啶配对，嘌呤之间或嘧啶之间不能配对 A-T配对通过2个氢键链接；G-C配对通过3个氢键链接 人与其他物种基因组大小比较 RNA二级结构与三级结构 碱基配对 DNA : A-T（配对）,T-A, G-C, C-G RNA：A-G （配对）,G-A, G-C, C-G, G-U（错配）,U-G（错配） 蛋白质、氨基酸、核酸与核苷酸 氨基酸是构成蛋白质的基本单位 氨基酸通过脱水缩合成肽，经过折叠加工等过程形成蛋白质 3个核酸确定一个氨基酸 核苷酸是核酸的基本单位 1200个左右碱基能确定一个基因 RNA基本知识 RNA—核糖核酸 RNA是单链结构 转录是在原核和真核细胞中以DNA为模板合成RNA的过程 RNA基本知识 在原核和真核生物中，DNA转录RNA过程是相似的。 DNA变性，RNA聚合酶结合在单链DNA上以5′→3′方向合成RNA分子。 双链中只有一条链作为转录模板，合成单链RNA分子。 RNA功能的多样性 1、控制蛋白质合成 2、作用于RNA转录后加工与修饰 3、基因表达与细胞功能调节 4、生物催化与其他细胞抽象功能 5、遗传信息加工与进化 清华大学 施一公教授（院士）的研究 清华大学 施一公教授（院士）的研究 清华大学 施一公教授（院士）的研究 清华大学 颜宁教授的研究 病毒RNA 病毒RNA是上述功能RNA的游离成分 病毒只含DNA或只含RNA，未见两者兼有病毒 RNA的分类 mRNA(信使RNA)： 是蛋白质合成（翻译）过程中的模版， 蛋白质 分子中 氨基酸的排列顺序，就是由mRNA 上每3个相邻的核苷酸形成的密码子的排列顺序决定的； tRNA(转运RNA): 是在蛋白质的合成过程中 转运氨基酸，为蛋白质的合成提供原料；并可准确识别 其所转运的氨基酸在mRNA 上的密码子； RNA的分类 rRNA(装配RNA)：约占RNA总量82% 主要是和一些蛋白质 组装成 一类重要的细胞器——核糖体，而核糖体 就是蛋白质合成的场所——“装配车间”； 复制机制是现代遗传学的基础 我们提出的特定的配对直接蕴涵遗传物质可能的复制机制 ------------James Watson Francis Crick 中心 定理 一旦“信息”传入蛋白，它就不能出来。信息由一个核酸传给另一个核酸，也可能从核酸传给蛋白。 但是，不可能由蛋白质传给核酸。此外，信息意味着准确确定的序列，或者是核酸中的基序列，或者是蛋白质中的氨基酸序列。 ------Francis Crick 中心定理模式 DNA RNA 蛋白质 生命编码秘密探究概述 主讲人：刘振栋 Email: liuzd2000@ ruanjianjiegou@126.com 计算机科学与技术学院 课时安排 共计32学时 3-13周 理论课无实验 总成绩：平时占 10%、作业20%、考试70% 关于教材 计算生物学导论-图谱、序列和基因组 M.S. Waterman （美）著 黄国泰、王天明 译 科学出版社，2009