生物信息学:第七 InterPro蛋白功能预测和GO.pptVIP

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  • 2017-11-27 发布于江苏
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生物信息学:第七 InterPro蛋白功能预测和GO.ppt

生物信息学:第七 InterPro蛋白功能预测和GO

第七讲 InterPro蛋白功能预测和GO功能分类 IntroPro 在domain的水平上对未知的序列进行注释 例:对给定的未知功能的序列预测其功能 InterPro 主页 InterPro主页上的功能有(左边): InterPro home Text Search InterProScan Databases Documentation Text Search InterProScan Databases Documentation 在InterProScan的页面上输入未知功能的序列 等待结果 显示预测到的结果:ABC transporter 点击结果页面左边的IPR003439查看更加详细的信息 点击结果页面左边的PF00005查看更加详细的信息 GO :基因本体论 三个成次: 1. biological_process (P) 2. cellular_component (C) 3. molecular_function(F) GO 主页 对前面预测到的结果进行功能分类:输入ABC transporter 显示查找到的结果 点击查看molecular_function成次(缩写F) 查找到IPR003439 作业:对给定的2个未知功能的序列(unknown1, unknown2 )使用InterPro预测其功能,并用GO

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