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附录生物信息数据库及相关分析服务器网址一览表
/cab/xueyuanxiashubumen/nx/bioinplant.htm 《生物信息学札记》 樊龙江
附录:生物信息数据库及相关分析服务器网址一览表
一、 重要主页(Important Home Pages)
二、 生物信息数据库(Bioinformation Databases)
1. 数据库目录
2. 综合数据库
3. DNA序列数据库
4. RNA序列和核糖体数据库。
5. 基因图谱数据库。
6. 人类基因组数据库。
7. 其他物种基因组数据库。
8. 基因表达数据库。
9. 基因突变、病理和免疫数据库。
10. 蛋白质序列数据库。
11. 蛋白质结构数据库。
12. 比较基因组学和蛋白质组学数据库。
13. 代谢途径和细胞调控数据库。
14. 与农林牧有关数据库。
15. 医学数据库。
16. 其他数据库
三、 生物信息学相关分析服务器(Bioinformatics Analysis Servers)
1. 使用手册等
2. 序列搜索和检索
3. 序列列线
4. 新序列发送
5. 序列开放阅读框(ORF)查找和翻译工具(
6. 蛋白质分析工具
7. PCR引物和探针数据库
*表中第二部分参照郝柏林、张淑誉编著的《生物信息学手册》,2000,上海科技出版社
152
/cab/xueyuanxiashubumen/nx/bioinplant.htm 《生物信息学札记》 樊龙江
重要主页
• European Molecular Biology Laboratory (EMBL) ,欧洲分子生物学实验室。
http://www.ebi.ac.uk/ebi_docs/embl_db/ebi/topembl.html
Cambridge, UK.
• UK Human Genome Mapping Project - Resource Center (HGMP-RC) ,英国医学研
究委员会所属人类基因组图谱资源中心。
http://www.hgmp.mrc.ac.uk/default.htm
• SeqNet: UK Node of European Molecular Biology Network (EMBNet) ,欧洲分
子生物学信息网。
http://www.seqnet.dl.ac.uk/default.htm
• GenBank ,美国国家生物技术信息中心 (NCBI)所维护的供公众自由读取的、带
注释的DNA序列的总数据库。
/Web/Search/index.html
GenBank at the National Center for Biotechnology (NCBI) of The National
Library of Medicine (NLM) at The National Institutes for Health (NIH)
campus, USA.
• National Center for Biotechnology Information (NCBI), 美国国家生物技术
信息中心
/
• DNA Databank of Japan (DDBJ) ,日本核酸数据库。
http://www.ddbj.nig.ac.jp/default.htm
• Genome Sequence DataBase (GSDB) ,美
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