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棉花学报 CottonScience
2017，29(3)：253--260
大丽轮枝菌侵染陆地棉早期的转录组分析
张志东，段兴鹏，周玉梅，李建福，韩松，高正银，赵佳薇，左开井+
(上海交通大学农,Ak与生物学院，上海200240)
摘要：【目的】旨在深入挖掘大丽轮枝菌致病相关基因。【方法】运用转录组测序技术比较分析了强致病力大丽
轮枝菌Vd991在侵染陆地棉品种Coker312早期阶段的基因表达情况。【结果】对Vd991侵染前后的转录组数
据进行差异表达分析，共筛选到979个差异表达基因(Differentiallyexpressedgenes，DEGs)，其中376个上调，
603个下调。通过基因注释和功能分类发现，这些DEGs涉及细胞增殖与生长、产孢、碳水化合物结合、蛋白激
酶活性调节、裂解酶活性、水解酶活性等功能。对上调DEGs进行基因本体(Geneontology，GO)功能富集分析，
发现共有277个GO词条达到显著富集水平(Po．05)，涉及生长速率正向调控、核苷酸合成、解旋酶活性等功
and
ofgenesgenomes，KEGG)通路分析表明，上调DEGs
能；京都基因与基因组百科全书(Kyotoencyclopedia
参与53个代谢通路，包括嘧啶代谢、嘌呤代谢等。【结论】在早期侵染过程中，大丽轮枝菌细胞增殖相关基因表
现活跃。上述分析为进一步揭示大丽轮枝菌的致病机理提供了有价值的参考。
关键词：大丽轮枝菌；转录组分析；细胞增殖；致病机理
中图分类号：$562．035文献标志码：A
DOI：10．1
文章编号：1002．7807(2017)03．0253．081963／1002．7807．zzdzkj
ofVerticilliumdahliaein Cottonat Infection
TranscriptomeAnalysis Upland Early Stage
byRNA-seq
Jianfu，Han Zhengyin，ZhaoJiawei，Zuo
ZhangZhidong，DuanXingpeng，ZhouYumei，LiSong，Gao Kaijing+
and University,Shanghai
(SchoolofAgricultureBiology,ShanghaiJiaotong 200240，China)
aimofthis istomine related ofVerticillium
Abstract：[Objective]Thestudy pathogenesisgenes dahliae．[Method]Weexplored
the toxicv．dahlestrainVd991atthe ofinfectioninCoker312．an cottoncultivar．
transcriptomeofhighly earlystage upland
differential totalof979 identifiedafterinfec—
[Result】Throughexpressionanalysis，a differentiallyexpressedgenes(DEGs)were
which376were and603were resultof annotationandclassificationsho
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