香菇分子遗传连锁图谱研究进展-论文.pdfVIP

食用菌学报⑥2016．23(4)：66～72 DOI：10．16488／j．cnki．1005—9873．2016．04．014 香菇分子遗传连锁图谱研究进展 董 慧1’2，章炉军1，于海龙1，张美彦1，刘建辉1，姜 宁1’2，宋春艳1，尚晓冬1，谭琦¨ (1上海市农业科学院食用菌研究所，农业部南方食用菌资源利用重点实验室，国家食用菌工程技术研究中心 上海市农业遗传育种重点实验室，上海201403；2上海海洋大学，上海201306) 摘要：综述了香菇(Lentinula edodes)遗传连锁图谱构建的研究现状，对现有的连锁图所涉及的分子标记、 作图群体、连锁群数量、图谱大小等进行了讨论，并对遗传连锁图谱意义和发展前景进行了分析与展望。 关键词：香菇；分子标记；遗传连锁图谱；数量性状定位；标记辅助育种 遗传连锁图谱，又叫遗传图谱，是以具有多态性的遗传标记为“路标”，以遗传学距离为图距的组 图，分为经典遗传图谱和分子遗传图谱两类。前者主要以形态标记和生化标记所构建，单位是重组率， 1％的重组率为1个遗传单位，分子遗传图谱则是用基因组内的基因及多态性DNA标记位点构成的图 谱，单位是厘摩(centiMorgan，cM)，1cM相当于1％的重组率，在高等植物中约为1×106个碱基对。 一般来说，染色体上两基因距离越近，重组率越小。目前国内外学者构建的遗传图谱大多为分子遗传 图谱‘1|。 构建遗传连锁图谱是遗传育种和基因克隆的基础，DNA分子标记在构建各类生物的遗传连锁图 个目的基因在x染色体上的排列顺序，以交换值为单位作出了第一个连锁图，从而奠定了遗传重组值 定位工作的基础[2]。自此，遗传连锁图在动植物中得到广泛发展，食用菌中香菇(Lentinulaedodes)、 糙皮侧耳(Pleurotus ostreatus)等的遗传连锁图谱的构建工作逐渐展开并成为研究热点。它能够显示 出所用的标记基因在染色体上的相对位置，是进行基因组结构和进化研究的基础，能够识别控制重要 性状的基因位点位置，是当前遗传学研究的重点研究方向。 香菇是世界上著名的食用菌之一，其生活史相对简单，遗传学方面的研究已相当深入，随着分子生 物学技术的Et益成熟，利用DNA分子标记和重要功能基因标记构建出高质量的分子遗传连锁图谱，对 Trait 于香菇目标基因的定位、数量性状定位(Quantitative Assisted Cloning)、标记辅助育种(Molecular 的意义。本文就香菇遗传连锁图谱的研究现状、影响构图质量的相关因素以及图谱构建的前景意义等 方面进行了综述，以期为未来香菇遗传连锁图谱的构建和遗传学分析提供参考。 1 香菇遗传连锁图谱的研究概况 1．1香菇遗传连锁图谱构建现状 amplified polymorphic 度基本一致。2002年，TERAsHIMIA等采用AFLP(amplified fragmentlength 收稿日期：2016—03—02原稿；2016—04—20修改稿 基金项目：现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS一24)资助 作者简介：董慧(1991一)，女，在读硕士，主要研究方向为食用菌遗传育种。 ”本文通讯作者E—mail：syjO@saas．sh．crl 万方数据 第4期 董慧，等：香菇分子遗传连锁图谱研究进展 67 efficiencygenomescanning)进一步完善了这张香菇遗传连锁图谱，在原有标记的基础上添加了221 个多态性AFLP标记以及21个基因标记，最终得到总长度为1398．4cM的香菇遗传连锁图叩]。该图 谱中有7个连锁群包含分支链接，可能是由于亲代菌株属于不同系统，在交互易位方面存在的差异导 related RAPD、ISSR(i