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- 2017-12-04 发布于江苏
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华侨大学生物信息学实验报告2
华侨大学计算机科学与技术学院
生物信息学实验报告
姓名:_______纪新婷_________ 学号:_1025112018_____
专业班级:_计算机科学与技术1班________
matlab软件Bioinformatics Toolbox工具包中的常用基本函数:
(1)baselookup(Complement, SeqNT)
baselookup(Complement, ugggauuauccaaaauguga)
ans =
ugggauuauccaaaauguga
ans =
ugggauuauccaaaauguga
函数 baselookup()的第一个叁数表示的是该函数所使用的方法,在这个例子中的“Complement”表示的是该函数所实现的功能是对核苷酸序列的补充,而”SeqNT”表示的是核苷酸的序列,在这个例子中我们引用得非典的核苷酸序列。
SeqRNA = dna2rna(SeqDNA)
SeqRNA = dna2rna(CCTGCCTTAATGTGCCTC)
SeqRNA =
CCUGCCUUAAUGUGCCUC
函数dna2rna(SeqDNA)实现的功能是将DNA序列转化为RNA序列,函数中的参数SeqDNA是DNA序列。
SeqR = seqreverse(SeqNT)
s = CCTGCCTTAATGTGCCTC;
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