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对生物信息学所学内容的简单总结 邹国兴 caas06f2_01 WebLab是北京大学生物信息中心开发出来的一个有关生物信息工具包集成的网站,利用这些工具可有效地开展生物信息相关的研究。本学期主要是学习文献检索、相关工具（主要是WebLab和emboss中工具）、有关软件的使用、生物信息学的基础知识、常用数据库和网站介绍。结合自身的工作实际,选择性地使用或练习了这些工具和软件，现对所学的内容做一个简单的总结。 一、序列比对 1、全局比对，用于两个序列全长对比分析、检查数据的质量、确定长的插入或缺失片段以及逐个分析序列中的突变点等。主要学习了needle，是我们学习的重点。 2、局部比对，用于分析两个序列同源性、进行逐个氨基酸残基的精细比对，这样可以获得高精度的序列对比结果。主要学习了water，自己再练习了matcher和wordmatch，以water 为例。 3、序列点阵图分析，序列间的重复以图形的形式来表示。重点学习了dotmatcher、dotpath、dottup、polydot四个工具,以dotmatcher为例。 4、多序列比对，来分析不同序列之间的差异，是学习的重点。主要学习了emma工具、软件WebLogo、MEGA和clustalx，以例来说明。 以10个植物的SBP蛋白质的结合域用emma来分析，用不同的颜色来显示序列的差异。 用上框粉红色中的序列以WebL