天然来源的寡聚脱氧核苷酸活性产物研究进展-中国医药生物技术.PDFVIP

64 中国医药生物技术 2015 年 2 月第 10 卷第 1 期 Chin Med Biotechnol, February 2015, Vol. 10, No. 1 DOI:10.3969/cmba.j.issn.1673-713X.2015.01.012 ·综述· 天然来源的寡聚脱氧核苷酸活性产物 研究进展 郭妍，惠长野，熊伟，谢英，杨新跃 单链寡聚脱氧核苷酸（oligodeoxynucleotide，ODN ）的 说，细菌基因组 DNA 是所有菌体中较保守的组成。细菌 生物学活性被证实与序列和空间构象特征有关，使得 ODN DNA 有着与脊椎动物 DNA 明显不同的结构特征，其中 类药物的开发成为近年来的研究热点[1] 。短链 ODN 库如果 CpG 二核苷酸出现频率高，胞嘧啶呈未甲基化状态；而脊 由 n 个脱氧核苷酸（deoxynucleotide，nt ）组成，理论上库 椎动物 DNA 中 CpG 二核苷酸出现频率低，并且 60% ~ 容量为 4n ，30 nt 的 ODN 库容量就高达 1018 。丰富的序 90% 胞嘧啶第 5 碳原子甲基化[7] 。这种差别使得细菌基因 列及空间构象是 ODN 活性的基础，高等真核生物和原核 组在进化过程中成为病原体相关分子模式（pathogen 生物来源的 ODN 表现了不同的生物学活性。 associated molecular patterns，PAMPs ），从而能够被脊椎动 在天然来源的高等真核生物 ODN 方面，欧洲的研究 物所识别，并产生相应的免疫应答。 重点是传统生化方法制备的 ODN 活性产物，其中最成功 对 GenBank 中收录的已完成全基因组测序的高等真 的 就 是 意 大 利 Gentium SpA 公 司 开 发 的 去 纤 苷 核及原核生物基因组 CpG 基序含量进行分析（表 1 ），哺 （defibrotide，DF ），猪源的主成分为 45 ~ 90 nt 的 ODN 混 乳动物的 CpG 含量在 2% ~ 2.5% ，鲑鱼 CpG 含量也只有 合物[2] 。目前，DF 临床试验主要围绕肝小静脉闭塞症 3.83% ；相对于高等真核生物，原核生物 CpG 含量非常高， （hepatic venular occlusive disease ，VOD ）的预防和治疗、 肠道益生菌嗜酸乳杆菌的 CpG 含量高达 6.68% ，致病菌结 多发性骨髓瘤的治疗、肿瘤的辅助治疗开展[2-4] 。不同于脊 核分枝杆菌 CpG 含量甚至高达 25.33% 。图 1 所示为各代 椎动物，原核生物基因组富含 CpG 基序，基于此差异设计 表物种基因组序列中 CpG 基序（黑色突出显示）局部分布 合成的 CpG ODN 在感染性、过敏性、免疫缺陷性疾病及 情况。正是高等真核生物及原核生物基因组 DNA 这一明 肿瘤的免疫治疗中表现了良好的应用前景[5] 。下面对高等真 显不同的结构特征，使得两种天然来源的 ODN 具有显著 核生物及原核生物基因组特点及两种来源的 ODN 活性产 不同的生物学活性。 物研究现状分述如下。 2 高等真核生物来源 ODN——