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第五章、病毒的复制
第五章 病毒基因组的复制 病毒的复制方式及概念 特殊的繁殖方式:不是以二分裂而是以复制的方式进行繁殖。 复制(replication):病毒感染敏感的宿主细胞后,病毒核酸进入细胞,一方面通过自我复制产生子代病毒核酸,另一方面进行表达,合成新的病毒蛋白质,然后由这些新合成的病毒组分装配成子代病毒体,并通过一定的方式释放到细胞外,病毒的这种特殊繁殖方式称为复制。 复制的意义 病毒的基因组携带有病毒的全部遗传信息,其基因组通过复制可以产生许多完全相同子代病毒基因组,并且能够准确无误地分配到子代病毒粒子中 。 意义:正是由于病毒核酸的这种自我复制能力,才保证了病毒的遗传信息相对稳定地逐代传递下去。 病毒基因组的复制具有一个共同的特点:不论哪一种复制方式都遵循原核和真核生物DNA复制时的碱基互补原则,因此只要知道病毒基因组一条链的碱基顺序,就可以合成与之相对应的互补链。 第一节 病毒基因组复制的基本特点 一、全保留复制和半保留复制 大多数dsDNA病毒的基因组复制与原核生物和真核生物的DNA复制一样,一般为半保留复制,如T4、T7、噬菌体、SV40、疱疹病毒等的基因组复制,但是呼肠孤病毒的dsRNA基因组则进行的是全保留复制或保留复制。 全保留复制:在复制过程中,病毒双链RNA中的两条RNA亲本链一直是缠绕在一起的,仅在复制点处有几个碱基对解链,并且在复制酶的作用下复制出一条子代RNA链,然后以这条新生链为模板合成互补链,由此产生子代dsRNA基因组 。 除了呼肠孤病毒的dsRNA基因组进行这样的复制外,一些由+ssRNA噬菌体基因组复制产生的复制中间体也能通过全保留复制形成子代+ssRNA基因组。 半保留复制:在复制过程中,病毒基因组的DNA双链解链成为两条单链,并分别以每条单链为模板,按照碱基配对互补的原则,合成出与之互补的新链,结果产生由一条新生链和一条亲链构成的子代病毒双链DNA。dsDNA病毒一般以半保留复制的方式进行复制。 二、病毒基因组的复制起始 大多数DNA病毒基因组的复制都是从一个复制起点即复制原点开始的。一般原核生物基因组的第一轮复制尚未完成之前,可以再从复制原点开始下一轮复制。 真核生物的基因组DNA上有许多复制原点同时起始复制,其复制叉的移动速度比原核生物慢,并且真核生物在第一轮复制和细胞分裂未完成之前,第二轮复制是不可能开始的。 DNA病毒基因组一般只有一个复制原点,其基因组DNA为单复制子,但单纯疱疹病毒(HSV)基因组DNA上有3个复制原点,分别称为oriL、oriS1和oriS2。 在DNA病毒基因组的复制原点区,通常含有反向重复序列,这种反向重复序列可以形成发夹结构,其发夹结构可能与病毒基因组的复制起始和调控有关。 如在噬菌体G4基因组的单链环状DNA进行复制时,几乎所有的单链部分都与单链DNA结合蛋白(SSB)结合,唯有发夹结构区是裸露的,这个区域就成为引发酶催化RNA引物合成的模板,随后宿主大肠杆菌DNA聚合酶III以这一RNA为引物,开始延伸合成DNA。 M13噬菌体DNA的复制原点也有发夹结构形成区,只是RNA引物的合成是由大肠杆菌RNA聚合酶(α2、β、 β、δ)催化的,而并非由引发酶催化合成。 脊髓灰质炎病毒含有正链RNA基因组,其5 端没有类似真核生物mRNA5 端的帽子结构,但5端有共价结合的VPg蛋白,其VPg-pUpU可能也是RNA基因组复制起始所必需的引物。 细小病毒由于ssDNA基因组的两端有末端重复序列形成的反转发夹结构,其反转发夹环可作为引物起始DNA的合成,因而不需要RNA引物的存在。 三、病毒基因组的复制方向 dsDNA病毒基因组的复制, 从复制原点开始,可以进行单向或双向复制,并由子代互补链的延伸形成复制叉。 单向复制时,只有一个复制叉;双向复制时则有两个复制叉,大部分dsDNA病毒基因组的复制是双向的。在这种情况下,双链DNA就会出现一个复制泡,在同一个复制泡上的两个复制叉是否为等速复制尚无定论。 也有一些dsDNA病毒如噬菌体P2、29、腺病毒基因组DNA以及X174的RF DNA的复制是单向的;还有的病毒基因组DNA既可以进行双向复制,也可以进行单向复制,如噬菌体早期采取式双向复制,晚期则进行滚式单向复制。 四、连续复制与不连续复制 大多数dsDNA病毒基因组以3→5方向的DNA链为模板,产生先导链,而以5 → 3方向的DNA链为模板,进行不连续复制,生成后随链。 dsDNA病毒的后随链是通过不连续复制产生的短片段连挡而成的,在真核生物基因组中,这种DNA短片段长度大约为100个核苷酸; 在原核生物基因组中,这种短片段长度则约有1000-2000个核苷酸,即所谓的冈崎片段,在复制过程中,这些片段由DNA连接酶连接起来,形成完整的子代DNA链。 不管是先导链
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