生物信息学课程标准.docVIP

《生物信息学》课程标准 第一部分 课程概述 一、课程名称 中文名称：《生物信息学》 英文名称：《Bioinformatics》 二、学时与适用对象 课程总计40学时，其中理论课18学时。本标准适用于四年制生物技术专业。 三、课程地位、性质 生物信息学是采用数学、统计学、和计算机等方法分析生物学、生物化学和生物物理学数据的一种综合学科。近二十年来，生命科学在分子水平上进行了广泛而深入的研究，随之而来的大量的数据结果需要处理，特别是生物化学、分子生物学以及遗传学的研究。这样就出现了生物信息学这门交叉学科。目前和未来的生物制药研发中，生物信息学处于非常重要的地位，大型数据库的建立、分子模建等生物信息学方法的应用对于新药的开发起到了极大的推动作用。对于生物技术专业的本科生，了解生物信息学的基本知识及分析方法对他们将来从事的生物制药职业非常重要。本课程需要大量的分子生物学知识，因此需要在学生掌握分子生物学知识后进行学习。 四、课程基本理念 1. 培养高质量的科研人员 生物信息学方法在未来的药物研发中将起到非常重要的作用，在基础生物学研究中也具有举足轻重的作用。掌握并熟练使用各种数据库和分子生物学软件可以帮助科研人员大大提高研究工作效率、掌握前沿的研究方法及进展。这同时也是从事分子生物学研究需要掌握的必要技能。 2. 生物信息数据库的学习 生物信息学主要的任务就是处理生物学数据，因此目前已经产生了许多生物信息学分析软件，包括大型商业软件以及一些自由软件。发达国家也建设了各种大型的分子生物学数据库，如：GenBank、EMBL、DDBJ等基因数据库以及各自的子数据库、衍生出来的蛋白数据库、结构数据库等等。生物信息学概论主要介绍各种大型分子生物学数据库、分子生物学软件的功能和使用。 3. 科研思路的学习 生物信息学与分子生物学关系密切，在学习生物信息学的过程中，学生可以体会各种科研课题的设计、需求，进一步锻炼科研思维，开拓眼界。 4.实践与理论结合 生物信息学是一门工具课，学会这些分析方法，离不开实践。本课程注重实践，设计了将近一半的计算机实习课时，考试也采用开卷式，让学生自己分析感兴趣的基因，注重本课程的应用性。 五、课程的设计思路 在充分理解总参军训和兵种部印发的《军队院校制定课程标准的基本要求》精神的前提下，遵循现代医学人才培养的要求，第四军医大学生物信息学课程设计思路如下： 1. 生物信息学课程的主要形式 《生物信息学》有理论课、实习课。理论课的安排是先学习绪论，帮助学生了解生物信息学的发展历程，以及与分子生物学的关系。复习基础分子生物学和基因组的知识，为后面学习各种分子生物学数据库做准备。然后介绍美国生物技术中心（NCBI）的各种数据库的基本知识和使用方法，欧洲蛋白质分析数据工具集Expasy的内容和使用方法，以及欧洲分子生物学实验室资源（EMBL）。给学生介绍几种常用的分子生物学软件的使用方法，在电脑中演示各种分析的操作。介绍生物信息的知识。最后给学生介绍我们开发的生物信息分析工具平台和综合生物信息分析工具平台EMBOSS的使用方法。考察方法也主要注重学生的实际应用能力。 2. 生物信息学课程中的实习课设计思路 本科生实习主要在计算机教室进行，教员对各种数据库的查询进行示教，学生对自己选择目标进行查询，以便熟悉各种数据库的使用方法，学生对一些生物信息软件进行操作，掌握实际的操作方法，并完成最后的测试题。主要注重培养学员的实践能力。 一、总体目标 通过对《生物信息学》的学习，使学生熟悉和掌握一些大型分子生物学数据库的结构和内容、查询分子生物学数据库的方法、分子生物学常用软件的使用方法，为将来从事的研究和开发做好充分的理论准备。 二、分类目标 生物信息学教学绪论部分主要以复习分子生物学和基因组学的基本知识为目的，各论部分主要要求学生掌握大型分子生物学数据库的组织结构和查询方法、一些常用分子生物学软件的使用方法和一些分子生物学工具平台的使用方法。通过系统学习《生物信息学》课程，应使学生熟悉分子生物学和基因组学的基本知识；了解并掌握大型分子生物学数据库NCBI、EMBL和Expasy的基本组织结构和使用方法；掌握常用分子生物学软件的使用方法，包括DNAstar、VectoNTI等软件；了解EMBOSS和抗体序列分析平台的工具种类和功能，初步掌握其使用方法三、情感态度与价值观 通过理论、网络等方式为主开展教学活动，学员逐步树立正确的人生观和价值观，形成辩证唯物主义世界观和方法论，增强自主学习能力，领悟科研人员以本职工作为重、遵循科学规律的精神，开阔学生的思路，接触世界最先进的分子生物学和生物信息学研究成果，培养高质量的科研人才。 教学内容与课时分配 篇、章 教学内容 学时分配 理论 实验 小计 第一章 绪论、生物大分子和遗传的分