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株鸭肝炎病毒1型全基因序列分析
中国农学通报 2010,26(14):8-12
Chinese Agricultural Science Bulletin
3 株鸭肝炎病毒1 型全基因序列分析
1,2 1,2 1,2 1,2 1,2
杨维星 ，施少华 ，陈红梅 ，万春和 ，程龙飞 ，
1 1 1 3 1
傅光华 ，林 芳 ，林建生 ，苏敬良 ，黄 瑜
1 2
（福建省农科院畜牧兽医研究所，福州350013 ；福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心，福州350013 ；
3 中国农业大学动物医学院，北京100094）
摘 要：为分析3 株1型鸭肝炎病毒（DHV ）的遗传变异和进化关系；采用RT-PCR 和5-/3-RACE.方法测定
3 株1 型鸭肝炎病毒全基因序列；研究结果表明，不含poly（A ）尾巴的3 株病毒的基因组全长为7691~
7700 nt ，基因组均仅含一个长度为6750 nt 的ORF ，625~627 nt 5端非翻译区和325~328 nt 3端非翻译区
(UTR)。将3 株病毒株与GeneBank 公布的其他DHV- 1全基因序列及小RNA 病毒科的其他属代表病毒
株进行序列分析表明，聚蛋白均被分割成为12 个蛋白，其中VP 1 的变异性最大，180~ 187位为高变区。3
株病毒与DHV- 1 参考毒株核苷酸序列同源性在93.7%~98.8% ，氨基酸序列同源性在96.9%~98.8% ，
DHV- 1各株在小RNA 科病毒多聚蛋白氨基酸序列进化树上形成一个独立的进化分支；DHVs- 1病毒间
核苷酸和氨基酸仍较保守，它们在进化中可将其归为小RNA 病毒科的一个新属。
关键词：鸭肝炎病毒1型；基因组；序列分析
中图分类号：S852.65+9.6 文献标志码：A 论文编号：2010-0256
Genomic Sequence Analysis of Three Strains of Duck Hepatitis Virus Type 1
Yang Weixing1,2, Shi Shaohua1,2, Chen Hongmei1,2 ，Wan Chunhe1,2, Cheng Longfei1,2,
1,2 1 1 3 1
Fu Guanghua , Lin Fang , Lin Jiansheng , Su Jingliang , Huang Yu
1
（Institute of Animal Husbandry and Veterinary Medicine, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou 350013;
2Fujian Animal Diseases Control Techology Development Center, Fuzhou 350013;
3College of Veterinary Medicine, China Agricultural University, Bei
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