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install gaussian in linuxGaussian 03 Opteron系统安装指南
Gaussian?03?Opteron系统安装指南系统需求Gaussian 03 C.02 源文件版PGI Fortran编译器 pgf77 5.1 (注:使用pgf90或者PGI 6.0都可能存在兼容问题无法编译)双核四路Opteron处理器Linux系统。注:Gaussian官方说明仅支持SuSE Linux 9.0,但本安装说明在 HP XC Linux 3.0 和 TurboLinux 上测试通过(部分系统可能需要进行细微修改,请参见“修改源码”部分)。二、安装前的设置1) 切换至C Shell,并设置g03root环境变量??? $ /bin/csh??? % setenv g03root /usr/pkg????? # 设置 G03 安装路径,这里将安装至 /usr/pkg/g03/ 目录。??? % cd $g03root2) 解压,并设置访问权限??? % tar xvfz wkssrc.tar.gz??? % chgrp -R g03 g03?????????????? # 设置 G03 访问权限,这里只有 g03 组的用户才可以使用 G03。??? % cd g03??? % ./bsd/install
三、修改源码Gaussian 03 C.02对某些Opteron系统可能出现不兼容的现象,若安装失败,可以尝试下列方法:1) 修改bsd目录下 cachesize 文件运行 $g03root/g03/bsd/cachesize 如果输出的不是一个整数,编译过程将出现错误而无法完成此时可以打开该文件,将grep cache /proc/cpuinfo | uniq | tr -d [:alpha:][:punct:]改为grep cache size /proc/cpuinfo | uniq | tr -d [:alpha:][:punct:]或者grep cache /proc/cpuinfo | uniq | tr -d [:alpha:][:punct:] | head -12) 到zixia BBS量化版或者量子化学网论坛 (/bbs/)量化类软件版发文求助
四、开始安装??? % source $g03root/g03/bsd/g03.login??? % bsd/bldg03 make.log
五、检查安装是否成功完成编译完成后,检查make.log文件结尾是否有编译错误终止的提示。运行??? % ls $g03root/g03/*.exe应该有80个文件。
六、修改登入批处理文件 .login??? # .login commands???????????????? ??? setenv g03root /usr/pkg??????? # 这里设置G03安装目录为 /usr/pkg/g03??????????? ??? setenv GAUSS_SCRDIR /scratch/? # 这里设置G03临时文件目录(rwf文件等)为 /scratch/????? ??? source $g03root/g03/bsd/g03.login
注:Gaussian 03 D.01支持PGI 6.0 以及 SuSE Linux 9.0, 9.1, 9.2, 9.3; SuSE Linux Enter. Server 9 SP3; RedHat Enterprise Linux 4 Update 2等多种Linux系统。G03其他版本升级至D.01需要100美元工本费(报价)。注2:感谢zixia BBS qchem和defoe关于G03安装问题的讨论。
Gaussian03?Linux下的设置获得已编译好的g03软件包:g03.tgz.假设解压至/home/g03, 即 tar xzf g03.tgz。然后在.bashrc(假设系统的shell默认是bash shell)加入如下环境变量export GAUSS_EXEDIR=/home/g03/g03export g03root=/home/g03export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/home/g03/g03export PATH=/home/g03/g03/:$PATHexport GAUSS_SCRDIR=/tmp?? 最后source .bashrc 或 . .bashrc即可。g98在单机?linux下编译及修改?link?详细完成版首先感谢在bbs上发文章的朋友(主要是zixia量化计算和厦大理论化学中心论坛)及身边的朋友,我的工作是在他们的基础上完成的。有了大家的帮助,我才从未接触过linux 和量化计算到能够完成这件事,
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