分子动力学模拟：神经元钙传感蛋白生理机制研究的新方向.docVIP

分子动力学模拟：神经元钙传感蛋白生理机制研究的新方向 朱玉珍1，张庆文2 (1上海师范大学体育学院，上海市 200234；2上海体育学院，上海市 200438) 引用本文：朱玉珍，张庆文. 分子动力学模拟：神经元钙传感蛋白生理机制研究的新方向[J].中国组织工程研究，2017，21():3224-3233. DOI:10.3969/j.issn.2095-4344.2017.20.018 ORCID: 0000-0002-3327-7976(朱玉珍) 文章快速阅读： 文题释义： 分子动力学模拟：分子动力学作为一种计算机模拟方法，是一门结合数学、物理、化学及生物学的综合技术。该方法主要依靠牛顿力学来模拟分子体系的运动，并从由分子体系的不同状态构成的系综中抽取样本，进而计算体系的构型积分，然后以构型积分的结果为基础，来计算体系的热力学量和其他宏观性质。 神经元钙传感蛋白：是一种能够触发信号转导的蛋白质，通过结合不同的靶体发挥多种生理功能，主要与中枢神经系统的发育和神经传递有关，并且通过增强神经递质的释放能有效传递突触神经末梢的神经刺激。 摘要 背景：神经元钙传感蛋白的生理功能及其发挥、结构折叠与解折叠的研究多采用实验方法进行研究，并提出蛋白可能的作用机制模型及维持结构稳定的可能因素，但实验手段受到时间和空间分辨的局限以及蛋白结构的复杂性，研究受到一定的限制，导致实验中提出的很多理论模型无法得以检验。分子动力学能够从原子水平上观察并解释实验现象，对理论假设和(或)模型进行验证，为实验提供参考和启示；也可以预测新的结构和现象，为建立理论模型和作用机制提供依据。 目的：分别对采用实验方法和分子动力学模拟的方法对神经元钙传感蛋白生理功能及其机制研究的进展进行梳理，并对今后的研究做一展望。 方法：以“Neuronal Calcium Sensor-1 or Neuronal Calcium Sensor1 or Neuronal Calcium Sensor 1 or NCS-1”为主题词，检索PubMed数据库中有关神经元钙传感蛋白研究的相关文献，下载全文进行阅读，排除与蛋白生理机制无关的文章，最终对72篇文献进行归纳总结。 结果与结论：①实验中主要对神经元钙传感蛋白在不同条件、不同位置中调控分泌、调控多巴胺D2受体、在肝细胞内调控腺苷A2A受体以及调控不同刺激下心肌细胞质和细胞核Ca2+等方面提出相关理论模型；②分子动力学模拟从结构的视角，对维持蛋白结构稳定的关键因素进行了分析和总结；③建议将两种方法结合起来，不断加深对蛋白生理机制的理解，共同推动研究的深入发展。 关键词： 组织构建；组织工程；神经元钙传感蛋白；生理机制；理论模型；结构；分子动力学模拟 主题词： 分子动力学模拟；多巴胺；肝细胞；组织工程 基金资助： 上海体育学院研究生教育创新科研项目资助(yjscx2015003) 缩略语： 神经元钙传感蛋白：neuronal calcium sensor-1，NCS-1 Molecular dynamics simulation: a new direction targeting physiological mechanisms of neuronal calcium sensor-1 protein Zhu Yu-zhen1, Zhang Qing-wen2 (1School of Physical Education, Shanghai Normal University, Shanghai 200234, China; 2Shanghai University of Sport, Shanghai 200438, China) Abstract BACKGROUND: Physiological functions, structural fold and unfolding of neuronal calcium sensor-1 (NCS-1) have been explored in a series of experiments, and then the possible mechanism models and key factors for remaining the structural stability are raised. But many functional models cannot be verified due to the limitations of resolution of the time and space and complex protein structure. The experimental phenomena and hypothesis