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一章蛋白质结构功能
第二章 蛋白质的结构与功能 大连医科大学 田余祥 第一节 蛋白质的分子组成 人文视角 三鹿奶粉事件 发生时间:2008年6月 原因:三鹿奶粉添加三聚氰胺,俗称“蛋白精”。 三聚氰胺的性状:。 危害:在体内形成的三聚氰胺氰尿酸盐,易在肾脏结晶沉淀,造成肾结石。 为何添加:食品和饲料工业通常采用“凯氏定氮法” 测定试样中的含氮量。 商人获利:蛋白质含量每增加一个百分点,用三聚氰胺的花费只有真实蛋白原料的1/5。 二、蛋白质的基本组成单位—氨基酸 (一)氨基酸的结构 组成蛋白质的编码氨基酸有20种,除甘氨酸(无不对称碳原子)外,均为L-?-氨基酸 (二)氨基酸的分类 根据氨基酸R基团在中性溶液中的极性和解离状态不同分为三类:中性氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸。 1.中性氨基酸 (1)非极性疏水性氨基酸 (2)极性疏水性氨基酸 2.酸性氨基酸 3.碱性氨基酸 (三)氨基酸的理化性质 1.等电点(isoelectric point,pI) 氨基酸解离成阴、阳离子程度相同时溶液的pH。 氨基酸的等电点(pI)计算: 氨基酸解离时其兼性离子两边pK的算术平均值。 以赖氨酸(Lys)为例: pI=1/2(pK2 +pKR)=1/2(8.95 + 10.53)= 9.74 2.氨基酸的紫外吸收 芳香族氨基酸(Tyr、Trp、Phe)分子中含有共轭双键,使得它们具有吸收紫外光的特性,最大吸收波长是在280 nm。 3.氨基酸与茚三酮的呈色反应 此反应可用于氨基酸的定性和定量分析 第二节 蛋白质的分子结构 一、肽键与肽 肽键(peptide bond)是一个氨基酸的?-羧基和另一氨基酸的?-氨基脱水缩合所形成的酰胺键。 氨基酸以肽键相连接形成的化合物称为肽。 蛋白质分子中的氨基酸之间即是以肽键相连。 人体内有一些生理活性物质是由几个至几十个氨基酸残基组成的肽,统称为生物活性肽。 二、蛋白质的一级结构 蛋白质分子中多肽链的氨基酸排列顺序和二硫键的位置。一级结构的化学键主要是肽键。 二、蛋白质的空间结构 (一)蛋白质的二级结构 指蛋白质分子中多肽链局部肽段主链原子的空间分布状态,不涉及其侧链原子的空间排布。 1.肽单元 (peptide unit)或肽键平面 形成肽键的C原子和N原子及与它们相连的两个α碳原子、O原子和H原子共处于同一平面。 2.蛋白质二级结构的主要构象及特点 常见的有?-螺旋、?-折叠、?-转角和无规卷曲。 维系蛋白质二级结构的主要化学键是氢键。 (1)?-螺旋(?-helix) (2)?-折叠(?- pleated sheet) (3)?-转角或?-回折(?-turn或?-bend) (4)无规卷曲(random coil) 模体(motif):是指蛋白质分子中具有二级结构的肽段相互靠近,形成具有特定功能的空间构象,或者仅是一个具有特定功能的很短的肽段。模体结构层次介于二级结构和三级结构之间,亦称为超二级结构 (二) 蛋白质的三级结构 蛋白质多肽链中所有原子(包括主链和侧链)在三维空间的排布位置与它们的相互关系。 由一条肽链构成的蛋白质分子发挥生物学功能必须具备完整的三级结构 稳定蛋白质三级结构的力量主要是侧链间的非共价键,如氢键、离子键(盐键)、疏水作用、Van der Waals力等。这些非共价键统称次级键 结构域(domain):分子较大的蛋白质分子中,多肽链在形成三级结构时可形成一个或数个球状或纤维状的区域,折叠得较为紧密,各行其功能。 (三)蛋白质的四级结构 许多蛋白质含有两条以上具有独立三级结构的多肽链,这些多肽链通过非共价键相互相互作用形成的多聚体结构。 每条具有独立三级结构的多肽链则称为此蛋白质的亚基(subunit)。 稳定蛋白质四级结构的化学键是氢键、离子键、疏水作用和Van der Waals力等非共价键。 具有四级结构的蛋白质,只有完整的四级结构才有活性,各单独的亚基通常无生物活性。 第三节 蛋白质结构与功能的关系 一、蛋白质一级结构与功能的关系 蛋白质的一级结构是其空间结构的基础,通常一级结构相似的蛋白质其空间结构也相似,功能也相似。 由于蛋白质分子中氨基酸的变异所导致的疾病被称为“分子病”。例如,镰状红细胞性贫血 研究不同种属之间同一蛋白质一级结构的差异,有助与人们了解物种进化之间的相互关系。 二、蛋白质空间结构与功能的关系 成人HbA1由两个α亚基和两个β亚基组成的的四聚体(α2β2)蛋白,它们通过8个离子键相连 血红蛋白(Hb)分子有紧张态(T态)和松弛态(R态)两种构象变化。 O2与Hb结合的正协同效应 Hb的一个亚基上的Fe2+与O2结合后, Fe2+落入卟啉环内,这样又带动F8组氨酸向卟啉
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